猪3号染色体上与窝产仔数相关的SNP位点

    公开(公告)号:CN105543358B

    公开(公告)日:2019-05-31

    申请号:CN201610003328.8

    申请日:2016-01-04

    Abstract: 本发明涉及与猪产仔数性状相关的SNP位点,具体涉及猪3号染色体上一个与窝产仔数相关的SNP位点及其引物,属生物技术领域。该SNP位点为基因组版本NCBI Build Sscrofa 10.2的Chr3:59516174;该位点的等位基因为T和C,有C/C、T/C和T/T三种基因型,扩增该位点的引物及延伸引物为:Chr3‑2‑PCRU:5’‑TAG TGG CCT CTT CCT GTC AC‑3’;Chr3‑2‑PCRL:5’‑CAA AAT AAG GAG CTG GTT CCT‑3’;Chr3‑2‑SNPU:5’‑AGG GGC AGC ACA GGC CCC CAT TCA G‑3’。带有T/C基因型的猪产仔数高于C/C基因型,T为提高猪产仔数的有益等位基因并且T/C杂合猪产仔数最高。本发明的有益效果在于:全基因组重测序方法能够快速、批量地筛选与性状相关的SNP位点或基因,基因组版本NCBI Build Sscrofa 10.2的Chr3:59516174这个位点能够作为遗传标记用于猪的遗传育种提高母猪的产仔数。

    猪4号染色体上与窝产仔数相关的SNP位点

    公开(公告)号:CN105543357B

    公开(公告)日:2019-05-31

    申请号:CN201610003244.4

    申请日:2016-01-04

    Abstract: 本发明涉及与猪产仔数性状相关的SNP位点,具体涉及猪4号染色体上一个与窝产仔数相关的SNP位点及其引物,属生物技术领域。该SNP位点为基因组版本NCBI Build Sscrofa 10.2的Chr4:113326205;该位点的等位基因为T和C,有C/C、T/C和T/T三种基因型,扩增该位点的引物及延伸引物为:Chr4‑2‑PCRU:5’‑AAA GCA TTA ATG ATA CAG CCT GC‑3’;Chr4‑2‑PCRL:5’‑TTG TGA ACT GGG TAA ATG GAA‑3’;Chr4‑2‑SNPU:5’‑ACT GAC TGA CTG ACT TTG AGT ACT GCT GTA GCT TCC AAT A‑3’。带有T/C基因型的猪产仔数高于T/T基因型,C为提高猪产仔数的有益等位基因并且T/C杂合猪产仔数最高。本发明的有益效果在于:全基因组重测序方法能够快速、批量地筛选与性状相关的SNP位点或基因,基因组版本NCBI Build Sscrofa 10.2的Chr4:37340666这个SNP位点能够作为遗传标记用于猪的遗传育种提高母猪的产仔数。

    猪13号染色体上一个与产仔数相关的分子标记及其引物

    公开(公告)号:CN103757009B

    公开(公告)日:2016-08-17

    申请号:CN201310729478.3

    申请日:2013-12-26

    Abstract: 本发明涉及与猪产仔数性状相关的分子标记,具体涉及猪13号染色体上一个与产仔数相关的分子标记及其引物,属生物技术领域。该分子标记位点为基因组版本NCBI Build Sscrofa10.2的Chr13:199018050;该位点的等位基因为T和C,有C/C、T/C和T/T三种基因型,该位点及其侧翼序列如SEQ ID NO:1所示。扩增该分子标记位点的引物及延伸引物为:Chr13?PCRU:5’?AAG CTG GTG ATG TTG CTA TCA?3’;Chr13?PCRL:5’?TAG TGA TGT GGG AGT GGA ACA?3’;Chr13?SNPU:5’?GAC TGA CTG ACT GAC TGA CTG TTA CAA TAG ATG TGA AGA CTG ACA?3’。带有T/T基因型的猪产仔数高于T/C和C/C基因型。本发明的有益效果在于:运用全基因组重测序方法,能够快速、批量地筛选与性状相关的分子标记或候选基因,Chr13:199018050这个位点能够作为遗传标记用于猪的遗传育种提高母猪的产仔数。

    猪11号染色体上一个与产仔数相关的分子标记及其引物

    公开(公告)号:CN103757005B

    公开(公告)日:2016-01-20

    申请号:CN201310727917.7

    申请日:2013-12-26

    Abstract: 本发明涉及与猪产仔数性状相关的分子标记,具体涉及猪11号染色体上一个与产仔数相关的分子标记及其引物,属生物技术领域。该分子标记位点为基因组版本NCBI Build Sscrofa10.2的Chr11:207484;该位点的等位基因为T和C,有C/C、T/C和T/T三种基因型,该位点及其侧翼序列如SEQ ID NO:1所示。扩增该分子标记位点的引物及延伸引物为:Chr11-PCRU:5’-ATG ACA TGC TGT TGC TCT GTC-3’;Chr11-PCRL:5’-AAC ATT CGA AGA CCG GGT A-3’;Chr11-SNPU:5’-CTG ACT GAC TCA AAG CCC CTC CTC TCA TCA CCC AG-3’。带有T/T基因型的猪产仔数高于T/C和C/C基因型。本发明的有益效果在于:运用全基因组重测序方法,能够快速、批量地筛选与性状相关的分子标记或候选基因,Chr11:207484这个位点能够作为遗传标记用于猪的遗传育种提高母猪的产仔数。

    猪HOXA1基因在种猪遗传疾患选育改良中的应用

    公开(公告)号:CN103421799B

    公开(公告)日:2015-07-01

    申请号:CN201310366944.6

    申请日:2013-08-21

    Abstract: 本发明公开了一种位于猪18号染色体上的导致外耳发育畸形(先天性无耳症)的HOXA1基因因果突变位点g.50111251G>TC及其在种猪遗传改良中的应用。针对该因果突变,本发明采用PCR-RFLP技术进行基因型判定,剔除携带不利等位基因g.50111251TC的个体,可以避免患病个体出生后不久即死亡带来的经济损失,从而提纯复壮中国地方猪种。

    猪13号染色体上一个与产仔数相关的分子标记及其引物

    公开(公告)号:CN103757009A

    公开(公告)日:2014-04-30

    申请号:CN201310729478.3

    申请日:2013-12-26

    Abstract: 本发明涉及与猪产仔数性状相关的分子标记,具体涉及猪13号染色体上一个与产仔数相关的分子标记及其引物,属生物技术领域。该分子标记位点为基因组版本NCBI?Build?Sscrofa10.2的Chr13:199018050;该位点的等位基因为T和C,有C/C、T/C和T/T三种基因型,该位点及其侧翼序列如SEQ?ID?NO:1所示。扩增该分子标记位点的引物及延伸引物为:Chr13-PCRU:5’-AAG?CTG?GTG?ATG?TTG?CTA?TCA-3’;Chr13-PCRL:5’-TAG?TGA?TGT?GGG?AGT?GGA?ACA-3’;Chr13-SNPU:5’-GAC?TGA?CTG?ACT?GAC?TGA?CTG?TTA?CAA?TAG?ATG?TGA?AGA?CTG?ACA-3’。带有T/T基因型的猪产仔数高于T/C和C/C基因型。本发明的有益效果在于:运用全基因组重测序方法,能够快速、批量地筛选与性状相关的分子标记或候选基因,Chr13:199018050这个位点能够作为遗传标记用于猪的遗传育种提高母猪的产仔数。

    猪6号染色体上一个与产仔数相关的SNP位点及其引物

    公开(公告)号:CN103757006A

    公开(公告)日:2014-04-30

    申请号:CN201310727928.5

    申请日:2013-12-26

    Abstract: 本发明涉及与猪产仔数性状相关的SNP位点,具体涉及猪6号染色体上一个与产仔数相关的SNP位点及其引物,属生物技术领域。该SNP位点为基因组版本NCBI?Build?Sscrofa10.2的Chr6:64826013;该位点的等位基因为T和C,有C/C、T/C和T/T三种基因型,该位点及其侧翼序列如SEQ?ID?NO:1所示。扩增该SNP位点的引物及延伸引物为:Chr6-2-PCRU:5’-GAC?GGC?CAA?GCA?GAA?CAG-3’;Chr6-2-PCRL:5’-TTG?GGG?CAG?ATT?AAT?ATT?TCA?A-3’;Chr6-2-SNPU:5’-ACT?GAC?TGA?CTG?ACT?CTG?ACA?AGA?ACG?TGT?CCA?CCG?AGC?C-3’。带有C/C基因型的猪产仔数高于T/C和T/T基因型。本发明的有益效果在于:运用全基因组重测序方法,能够快速、批量地筛选与性状相关的SNP位点或候选基因,Chr6:64826013这个位点能够作为遗传标记用于猪的遗传育种提高母猪的产仔数。

    猪11号染色体上一个与产仔数相关的分子标记及其引物

    公开(公告)号:CN103757005A

    公开(公告)日:2014-04-30

    申请号:CN201310727917.7

    申请日:2013-12-26

    Abstract: 本发明涉及与猪产仔数性状相关的分子标记,具体涉及猪11号染色体上一个与产仔数相关的分子标记及其引物,属生物技术领域。该分子标记位点为基因组版本NCBI?Build?Sscrofa10.2的Chr11:207484;该位点的等位基因为T和C,有C/C、T/C和T/T三种基因型,该位点及其侧翼序列如SEQ?ID?NO:1所示。扩增该分子标记位点的引物及延伸引物为:Chr11-PCRU:5’-ATG?ACA?TGC?TGT?TGC?TCT?GTC-3’;Chr11-PCRL:5’-AAC?ATT?CGA?AGA?CCG?GGT?A-3’;Chr11-SNPU:5’-CTG?ACT?GAC?TCA?AAG?CCC?CTC?CTC?TCA?TCA?CCC?AG-3’。带有T/T基因型的猪产仔数高于T/C和C/C基因型。本发明的有益效果在于:运用全基因组重测序方法,能够快速、批量地筛选与性状相关的分子标记或候选基因,Chr11:207484这个位点能够作为遗传标记用于猪的遗传育种提高母猪的产仔数。

    猪6号染色体上一个与产仔数相关的分子标记

    公开(公告)号:CN103757002A

    公开(公告)日:2014-04-30

    申请号:CN201310727885.0

    申请日:2013-12-26

    Abstract: 本发明涉及与猪产仔数性状相关的分子标记,具体涉及猪6号染色体上一个与产仔数相关的分子标记及其引物,属生物技术领域。该分子标记位点为基因组版本NCBI?Build?Sscrofa10.2的Chr6:103465181;该位点的等位基因为T和C,有C/C、T/C和T/T三种基因型,该位点及其侧翼序列如SEQ?ID?NO:1所示。扩增该分子标记位点的引物及延伸引物为:Chr6-3-PCRU:5’-AAA?AAC?AGT?CGT?GTG?CCC?T-3’;Chr6-3-PCRL:5’-ATA?CTA?TCT?GCA?TGT?ATA?GAG?GAA?CTT?AAA-3’;Chr6-3-SNPU:5’-GAC?TGA?CTG?ACT?GAC?TGA?CTT?TCA?GTG?TCT?CAT?GTA?GAA?TCA?TCA-3’。带有C/C基因型的猪产仔数高于T/C和T/T基因型。本发明的有益效果在于:运用全基因组重测序方法,能够快速、批量地筛选与性状相关的分子标记或候选基因,Chr6:103465181这个位点能够作为遗传标记用于猪的遗传育种提高母猪的产仔数。

    猪HOXA1基因在种猪遗传疾患选育改良中的应用

    公开(公告)号:CN103421799A

    公开(公告)日:2013-12-04

    申请号:CN201310366944.6

    申请日:2013-08-21

    Inventor: 任军

    Abstract: 本发明公开了一种位于猪18号染色体上的导致外耳发育畸形(先天性无耳症)的HOXA1基因因果突变位点g.50111251G>TC及其在种猪遗传改良中的应用。针对该因果突变,本发明采用PCR-RFLP技术进行基因型判定,剔除携带不利等位基因g.50111251TC的个体,可以避免患病个体出生后不久即死亡带来的经济损失,从而提纯复壮中国地方猪种。

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