公开(公告)号：CN112349347B

公开(公告)日：2023-11-10

申请号：CN202011028667.4

申请日：2020-09-25

Applicant: 江苏农林职业技术学院

Inventor： 陈曦 ,  戚维聪 ,  张德海 ,  顾淑淑 ,  陈洁

IPC: G16B20/30 ,  C12Q1/6895

Abstract: 本发明公开了一种草莓功能基因连锁SSR标记的开发方法，包括如下步骤：(1)获取草莓基因组公共数据；(2)对数据进行质量控制处理，处理后的序列进行组装拼接并鉴定微卫星序列；(3)在微卫星序列的旁侧序列设计引物；(4)不同草莓品种的转录组测序、拼接和基因注释；(5)电子PCR锚定引物到具体基因。该方法的SSR标记具有多态性高、共显性、重复性好等优点。为草莓提供2468个SSR标记及其引物，且这些标记都和功能基因相关，这将为草莓育种和农业性状相关的基因挖掘提供有利的工具。

公开(公告)号：CN112349347A

公开(公告)日：2021-02-09

申请号：CN202011028667.4

申请日：2020-09-25

Applicant: 江苏农林职业技术学院

Inventor： 陈曦 ,  戚维聪 ,  张德海 ,  顾淑淑 ,  陈洁

IPC: G16B20/30 ,  C12Q1/6895

Abstract: 本发明公开了一种草莓功能基因连锁SSR标记的开发方法，包括如下步骤：(1)获取草莓基因组公共数据；(2)对数据进行质量控制处理，处理后的序列进行组装拼接并鉴定微卫星序列；(3)在微卫星序列的旁侧序列设计引物；(4)不同草莓品种的转录组测序、拼接和基因注释；(5)电子PCR锚定引物到具体基因。该方法的SSR标记具有多态性高、共显性、重复性好等优点。为草莓提供2468个SSR标记及其引物，且这些标记都和功能基因相关，这将为草莓育种和农业性状相关的基因挖掘提供有利的工具。