公开(公告)号：CN119418776A

公开(公告)日：2025-02-11

申请号：CN202411475875.7

申请日：2024-10-22

Applicant: 江苏农林职业技术学院

Inventor： 刘松 ,  宋微 ,  吴刚山 ,  梅佳琪 ,  陆红飞 ,  潘维

IPC: G16B40/00 ,  G16B25/20 ,  G16B30/20 ,  G16B45/00 ,  G16B50/10 ,  G16B50/30

Abstract: 本发明公开了一种基于高通量技术的非模式物种转录组测序结果分析方法，具体包括如下步骤：(1)使用Fastp软件对高通量测序数据质控；(2)使用Trinity软件进行转录组的De novo组装；(3)使用CD‑HIT软件对组装后的序列去除冗余；(4)使用BUSCO软件对组装后的非冗余转录本进行完整性评估；(5)针对组装结果进行生物信息学分析，包括基因功能注释、CDS预测、SSR分析、转录因子识别。本发明通过以上步骤提形成了全面、完善的流程化分析方法，为非模式物种转录组测序结果分析提供了有效参考。