基于原子力显微镜的启动子体外强度表征的新方法

    公开(公告)号:CN107368709A

    公开(公告)日:2017-11-21

    申请号:CN201710692220.9

    申请日:2017-08-14

    Applicant: 江南大学

    Abstract: 本发明公开了一种基于原子力显微镜(atomic force microscopy,AFM)的启动子体外强度表征的方法。首先在液体环境中采集得到1000多条启动子-RNA聚合酶力-距离曲线,设定10-40nm的解离距离内最末一个出现的解离事件为单对分子的特异性交互作用事件,采集这些事件的解离力。绘制这些解离力分布图,通过高斯拟合(Gaussian Fitting)分析得到最可能的交互作用力值,并且统计在所有得到的力曲线中,存在符合特异性结合事件的曲线的概率。通过相关性分析,论证了本发明建立的基于AFM力谱技术结合统计学分析的启动子分析方法的可行性和有效性。

    一种基于原子力显微镜体外分析启动子与RNA聚合酶间交互作用的方法

    公开(公告)号:CN107621555A

    公开(公告)日:2018-01-23

    申请号:CN201710696236.7

    申请日:2017-08-15

    Applicant: 江南大学

    Abstract: 本发明公开了一种在体外基于原子力显微镜(atomic force microscope,AFM)分析启动子与RNA聚合酶间交互作用的方法。首先将抛光的单晶硅片进行羟基化处理,硅烷化处理,再经戊二醛将RNA聚合酶固定。在AFM金镀层探针上以自组装单分子层(Self-assembled monolayers,SAMs)的形式获得启动子修饰的AFM探针;通过AFM力谱技术,控制AFM探针与基底表面靠近,停留并且最终分开,从而记录能够反映启动子与RNA聚合酶会特异性结合的力-距离曲线,进而获得RNA聚合酶与启动子的结合-解离过程中的生物物理学参数。

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