公开(公告)号：CN118726624A

公开(公告)日：2024-10-01

申请号：CN202411043510.7

申请日：2024-07-31

Applicant: 武汉明德生物科技股份有限公司

Inventor： 王庆 ,  王颖 ,  胡韶华 ,  赵淑云 ,  樊齐静 ,  廖瑞 ,  方涛

IPC: C12Q1/689 ,  C12Q1/6895 ,  C12Q1/6883 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明属于生物医学技术领域，具体公开了一种用于检测结核合并感染的试剂盒，该试剂盒可实现白色念珠菌、黑曲霉、胞内分枝杆菌、铜绿假单胞菌、烟曲霉、光滑念珠菌、肺炎克雷伯菌、肺炎链球菌以及龟分枝杆菌、鼻疽诺卡菌、脆弱拟杆菌、卡他莫拉菌、米勒链球菌、苏云金芽孢杆菌、咽峡炎链球菌、中间链球菌、构巢曲霉、黄曲霉、克柔念珠菌、米曲霉等44个病原体的检测，覆盖了结核合并感染的热点和罕见病原体；其中试剂盒优选包括36条特异性引物(即TB1‑F～TB18‑R)，该引物组合更为精简且能够提升结核合并感染的检出能力。利用本发明试剂盒的病原体检出结果，有助于临床针对性用药，对实现个体化有效治疗具有重要意义。

公开(公告)号：CN117877579A

公开(公告)日：2024-04-12

申请号：CN202311784402.0

申请日：2023-12-21

Applicant: 武汉明德生物科技股份有限公司

Inventor： 廖瑞 ,  王颖 ,  龙志成 ,  方涛 ,  张艳

IPC: G16B20/30 ,  G16B25/20 ,  G16B50/00

Abstract: 本发明公开了一种用于Nanopore靶向测序的嵌合体过滤方法，具体为：基于各病原微生物基因组上靶向区域设计的引物进行多重扩增，扩增后使用Nanopore平台建库试剂盒进行建库并上机测序，将测序结果比对至针对病原微生物靶向区域构建的索引文件上，并对比对后的文件进行特定的过滤处理，根据过滤后测序结果比对至靶向区域的reads数，获得病原微生物的检出情况。通过本发明方法，可以有效减少测序结果中嵌合体等数据的干扰，从而提升病原微生物检出的准确性。

公开(公告)号：CN116445588A

公开(公告)日：2023-07-18

申请号：CN202310335680.1

申请日：2023-03-28

Applicant: 武汉明德生物科技股份有限公司

Inventor： 张骥诚 ,  王颖 ,  廖瑞 ,  方涛 ,  龙志成 ,  赵淑云

IPC: C12Q1/6851 ,  C12Q1/6888 ,  C12Q1/70 ,  C12Q1/6869

Abstract: 本发明公开了用于病原微生物快速检测的定量参考品和检测方法，本发明提供的定量参考品的序列与任意物种的核酸序列均不重叠，并基于该定量参考品提供了一种病原微生物快速检测方法。本发明通过引入定量参考品，在建库阶段即可通过样本浓度和毛细管电泳结果直观判断建库是否成功，极大缩短了失败样本判断时间与成本，进而缩短实验周期；而且本发明方法可用于检测含有人源基因组DNA的核酸样本，不仅检出限低，且可实现大量不同类型病原微生物的同时检出，检测时间也可缩短至4‑6h，对病原微生物的快速即时检测具有重要意义。

公开(公告)号：CN118588165A

公开(公告)日：2024-09-03

申请号：CN202410731333.5

申请日：2024-06-06

Applicant: 武汉明德生物科技股份有限公司

Inventor： 龙志成 ,  王颖 ,  廖瑞 ,  张艳 ,  方涛

IPC: G16B25/20

Abstract: 本发明公开了一种基于kmers的物种特异性引物对设计方法及系统，该方法包括如下步骤：筛选并获取目标病原微生物多个基因组文件；利用基因组文件生成kmers序列集合，同时基于TM值和各集合间的比对获取保守kmers；将保守kmers比对至NCBI NT库，根据比对结果生成候选引物对；对候选引物对进行去冗余处理，得到物种特异性引物对。本发明方法适用广泛，且获取的物种特异性引物对的检测精度更高，可以大大减少测序量并提高检测准确性，为开发多重病原微生物PCR检测体系提供了一种新策略。

公开(公告)号：CN118308502A

公开(公告)日：2024-07-09

申请号：CN202410555686.4

申请日：2024-05-07

Applicant: 武汉明德生物科技股份有限公司

Inventor： 樊齐静 ,  王颖 ,  方亮 ,  王庆 ,  赵淑云 ,  廖瑞 ,  方涛

IPC: C12Q1/689 ,  C12N15/11 ,  C12Q1/6869 ,  C12R1/32

Abstract: 本发明公开了检测结核分枝杆菌耐药基因的引物组、试剂盒及方法，其中耐药基因包括rpoB、katG、inhA、ahpC、embB、embA、pncA、rrs、rpsL、gyrA、gyrB、eis、rv0678、atpE、rplC、rrl、ddn、ethA、thyA和folC，引物组至少包括如SEQ ID NO:1至SEQ ID NO:52所示的引物；本发明将多重PCR扩增技术与纳米孔测序技术相结合，通过靶向捕捉耐药基因后进行高通量测序，从而实现耐药突变的检测。本发明能够同时提供20种耐药基因目标区域内所有SNP位点的突变信息，且耐药性预测范围包含常见一线、二线抗结核药物以及贝达喹啉、德拉马尼、普托马尼等抗结核新药，对结核分枝杆菌耐药性判断具有价值。

公开(公告)号：CN116189774A

公开(公告)日：2023-05-30

申请号：CN202310319074.0

申请日：2023-03-29

Applicant: 武汉明德生物科技股份有限公司

Inventor： 龙志成 ,  王颖 ,  廖瑞 ,  方涛 ,  张骥诚 ,  赵淑云

IPC: G16B30/00 ,  C12Q1/6869 ,  G16B40/00

Abstract: 本发明公开了一种基于基因组序列的超多重PCR阳性评估方法，该方法包括以下步骤：截取每个物种基因组上与其靶区域对应的区段，建立区段与物种的对应关系，并构建索引；将多重PCR的测序结果比对至索引上，获取比对至每个区段的reads数；根据每个物种设计的靶区域数和实际检出的靶标数目引入置信度计算公式，并根据每个物种的置信度确认是否为真实阳性检出。本发明通过引入特定的置信度计算公式，可有效消除测序结果中由非特异性扩增、或引物保守度不高等因素导致的假阳性，提高检测准确性。

公开(公告)号：CN115851891A

公开(公告)日：2023-03-28

申请号：CN202211506377.5

申请日：2022-11-29

Applicant: 武汉明德生物科技股份有限公司

Inventor： 龙志成 ,  王颖 ,  席再军 ,  方涛 ,  张骥诚 ,  廖瑞 ,  赵淑云 ,  王庆

IPC: C12Q1/686 ,  G16B25/20 ,  G16B30/10 ,  G16B35/20 ,  G16B50/00 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明公开了一种超多重特异性PCR引物组设计方法和系统，所述方法包括病原微生物基因序列的获取、参考基因序列的筛选、基因序列的片段化、基因序列的比对、引物设计及优化等过程。通过本发明所述方法获得的引物组特异性高，检测灵敏度更优，检测精度更高，且可以实现对细菌、真菌、寄生虫、病毒和耐药基因的检测。

公开(公告)号：CN115786548A

公开(公告)日：2023-03-14

申请号：CN202211198646.6

申请日：2022-09-29

Applicant: 武汉明德生物科技股份有限公司

Inventor： 张骥诚 ,  王颖 ,  席再军 ,  廖瑞 ,  方涛 ,  龙志成

IPC: C12Q1/689 ,  C12Q1/686 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明公开了用于病原微生物耐药基因检测的引物组、试剂盒及方法，所述引物组包括序列如SEQ ID NO.2n‑1所示的F端引物，以及与F端引物对应的R端引物序列如SEQ ID NO.2n所示，其中n的数值为1～17。本发明提供的引物组可以实现同时多达20种不同类型耐药基因的检测，且检测稳定性高，准确性高；使用该引物组和检测方法，在6‑8小时即可完成整个耐药基因检测过程，实现了病原微生物耐药基因的快速检测。