公开(公告)号：CN118711672A

公开(公告)日：2024-09-27

申请号：CN202410802421.X

申请日：2024-06-20

Applicant: 武汉大学

Inventor： 刘娟 ,  张蔷 ,  杨锋 ,  黄伟鸿

IPC: G16B40/00 ,  G16B50/10 ,  G06N3/042 ,  G06N3/0464 ,  G06N3/0455 ,  G06N3/084

Abstract: 本发明提出了一种基于拓扑感知注意力网络的蛋白质功能预测方法及装置，其中的方法包括如下步骤S1：获取公开蛋白质功能注释数据集、公开的描述基因本体及关系obo文件；S2：构建蛋白质图输入和基因本体图输入；S3：搭建基于拓扑感知的蛋白质‑基因本体论注意力网络，其中包括拓扑感知的注意力模块和多头聚合器；S4：利用步骤S1中的数据对步骤S3中的拓扑感知的蛋白质‑基因本体注意力网络进行训练，得到训练好的蛋白质功能预测模型。S5：对待一个待预测功能的蛋白质，利用步骤S5中的训练好的模型生成其被每一个GO术语注释的概率。通过本发明的方法可以提升蛋白质功能预测的效果。