公开(公告)号：CN118497384A

公开(公告)日：2024-08-16

申请号：CN202410715475.2

申请日：2024-06-04

Applicant: 杭州杰毅生物技术有限公司

Inventor： 刘莉莉 ,  高晓庆 ,  王计超 ,  姚瑶 ,  朱莉莉 ,  周逸文 ,  丁文超 ,  韩序 ,  王珺

IPC: C12Q1/689 ,  C12Q1/6895 ,  C12Q1/686 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明提出了一种基于多重PCR技术和高通量测序技术的微生物核酸检测技术和试剂盒。该技术流程主要包括：引物设计、多重PCR扩增、片段化建库、上机测序以及生信分析，可快速、准确地检测微生物病原体。该检测试剂盒主要包含多对细菌及真菌通用型扩增引物，通过引物的多重PCR扩增，可以在较低NGS测序数据量的情况下，高效、特异性地检测病原微生物，进而辅助诊断微生物感染疾病。

公开(公告)号：CN113113085A

公开(公告)日：2021-07-13

申请号：CN202110278297.8

申请日：2021-03-15

Applicant: 杭州杰毅生物技术有限公司

Inventor： 丁文超 ,  薛继统 ,  韩序 ,  周逸文 ,  王珺

IPC: G16B30/10 ,  G06N3/04 ,  G06N3/08 ,  G16B20/20 ,  G16B20/30 ,  G16B40/20

Abstract: 本发明公开了一种基于人工智能的用宏基因组测序数据进行肿瘤检测的分析系统，包括：用于过滤低质量序列的数据过滤模块、用于将序列比对至人参考基因组上的数据比对模块、用于获取样本的染色体波动变异情况的染色体波动分析模块、用于判断样本是否含有肿瘤信号的基于人工智能的肿瘤信号识别模块。本发明的分析系统具有分析时间短、准确性高的优点，可以利用常规mNGS测序数据来检测肿瘤，实现一份样本在检测病原体的情况下同时进行肿瘤检测的功能。

公开(公告)号：CN118711657B

公开(公告)日：2024-11-12

申请号：CN202411206931.7

申请日：2024-08-30

Applicant: 杭州杰毅生物技术有限公司

Inventor： 陈璟 ,  周逸文 ,  丁文超 ,  韩序 ,  王珺

IPC: G16B20/30 ,  G16B30/10 ,  G16B5/00 ,  G16B40/00 ,  G06N3/0499 ,  G06N3/08

Abstract: 本发明涉及生物信息技术领域，具体地涉及一种NGS测序中针对标签跳跃污染的假阳性排除方法及系统。方法主要步骤为：获取各样本的带标签的致病检出序列数量和带标签的中间体序列数量，并确定强阳性样本及source值；计算基准强阳性样本对其他所有弱阳性样本的预测污染压力，通过检验预测模型获得各弱阳性样本的预测污染压力值；接着将任意一个弱阳性样本的所有预测污染压力值求和，获得该弱阳性样本的实际Hopping期望值；依次对比各弱阳性样本的实际Hopping期望值与该弱阳性样本的带标签的致病检出序列数量的大小，并输出该弱阳性样本的预测结果。该方法可以评估样本受到其他样本的Hopping压力，给出各假阳性样本的阳性/阴性预测结果，帮助诊断报告人员提高报告效率。

公开(公告)号：CN118711657A

公开(公告)日：2024-09-27

申请号：CN202411206931.7

申请日：2024-08-30

Applicant: 杭州杰毅生物技术有限公司

Inventor： 陈璟 ,  周逸文 ,  丁文超 ,  韩序 ,  王珺

IPC: G16B20/30 ,  G16B30/10 ,  G16B5/00 ,  G16B40/00 ,  G06N3/0499 ,  G06N3/08

Abstract: 本发明涉及生物信息技术领域，具体地涉及一种NGS测序中针对标签跳跃污染的假阳性排除方法及系统。方法主要步骤为：获取各样本的带标签的致病检出序列数量和带标签的中间体序列数量，并确定强阳性样本及source值；计算基准强阳性样本对其他所有弱阳性样本的预测污染压力，通过检验预测模型获得各弱阳性样本的预测污染压力值；接着将任意一个弱阳性样本的所有预测污染压力值求和，获得该弱阳性样本的实际Hopping期望值；依次对比各弱阳性样本的实际Hopping期望值与该弱阳性样本的带标签的致病检出序列数量的大小，并输出该弱阳性样本的预测结果。该方法可以评估样本受到其他样本的Hopping压力，给出各假阳性样本的阳性/阴性预测结果，帮助诊断报告人员提高报告效率。

公开(公告)号：CN113113085B

公开(公告)日：2022-08-19

申请号：CN202110278297.8

申请日：2021-03-15

Applicant: 杭州杰毅生物技术有限公司

Inventor： 丁文超 ,  薛继统 ,  韩序 ,  周逸文 ,  王珺

IPC: G16B30/10 ,  G06N3/04 ,  G06N3/08 ,  G16B20/20 ,  G16B20/30 ,  G16B40/20

Abstract: 本发明公开了一种基于人工智能的用宏基因组测序数据进行肿瘤检测的分析系统，包括：用于过滤低质量序列的数据过滤模块、用于将序列比对至人参考基因组上的数据比对模块、用于获取样本的染色体波动变异情况的染色体波动分析模块、用于判断样本是否含有肿瘤信号的基于人工智能的肿瘤信号识别模块。本发明的分析系统具有分析时间短、准确性高的优点，可以利用常规mNGS测序数据来检测肿瘤，实现一份样本在检测病原体的情况下同时进行肿瘤检测的功能。

公开(公告)号：CN114107290A

公开(公告)日：2022-03-01

申请号：CN202111374708.X

申请日：2021-11-19

Applicant: 杭州杰毅生物技术有限公司

Inventor： 欧阳川 ,  王珺 ,  周逸文 ,  王江浩 ,  刘紫丹

IPC: C12N15/11 ,  C12Q1/6869 ,  G16B20/30

Abstract: 本发明涉及分子生物学技术领域，尤其是核酸测序，具体涉及一种测序接头及其测序分析系统。其中，测序接头呈部分互补配对的Y字形结构，其中一条链从5’至3’依次包括：内部Index序列、Index1测序引物结合区域序列、Index1序列、与芯片探针结合的P7序列；另一条链上从5’至3’依次包括：与芯片探针结合的P5序列、Read1测序引物结合区域序列、内部Index序列和T碱基垂悬。这两条链的内部标签序列区域完全互补配对，测序引物结合区域序列部分互补配对。使用人为平衡过碱基比例的、不同长度的内部Index序列接头组合时，可以在保证较高的测序质量和通量下，实现多个样本的边测序边分析，极大地缩短了周转时间，提高了检测的时效。