公开(公告)号：CN112071369A

公开(公告)日：2020-12-11

申请号：CN202010944760.3

申请日：2020-09-10

Applicant: 暨南大学附属第一医院(广州华侨医院)

Inventor： 王莹莹 ,  李克深

IPC: G16B40/00 ,  G16B45/00 ,  G16B25/10

Abstract: 本发明公开了一种模块标记物挖掘方法、装置、计算机设备及存储介质，所述方法包括：构建初始miDCN网络；构建mDCN网络和mi‑m‑DCN网络，对初始miDCN网络进行拓展，形成拓展miDCN网络；对初始miDCN网络和拓展miDCN网络进行模块挖掘，得到miDCN模块；获取金标准miRNA集合；获取金标准miRNA集合在miDCN模块中的miRNA之间的连接关系；计算金标准miRNA集合中的miRNA与miDCN模块中其余miRNA的度的相似性，将miDCN模块中相似性最高的miRNA作为新标记物。本发明结合了miRNA与mRNA两个层面的数据，并充分利用二者之间的生物学关系，挖掘复杂疾病的miRNA模块标记物，具有更加全面、系统和可移植性的特点。

公开(公告)号：CN112071369B

公开(公告)日：2021-08-03

申请号：CN202010944760.3

申请日：2020-09-10

Applicant: 暨南大学附属第一医院(广州华侨医院)

Inventor： 王莹莹 ,  李克深

IPC: G16B40/00 ,  G16B45/00 ,  G16B25/10

Abstract: 本发明公开了一种模块标记物挖掘方法、装置、计算机设备及存储介质，所述方法包括：构建初始miDCN网络；构建mDCN网络和mi‑m‑DCN网络，对初始miDCN网络进行拓展，形成拓展miDCN网络；对初始miDCN网络和拓展miDCN网络进行模块挖掘，得到miDCN模块；获取金标准miRNA集合；获取金标准miRNA集合在miDCN模块中的miRNA之间的连接关系；计算金标准miRNA集合中的miRNA与miDCN模块中其余miRNA的度的相似性，将miDCN模块中相似性最高的miRNA作为新标记物。本发明结合了miRNA与mRNA两个层面的数据，并充分利用二者之间的生物学关系，挖掘复杂疾病的miRNA模块标记物，具有更加全面、系统和可移植性的特点。