公开(公告)号：CN103279645B

公开(公告)日：2016-05-25

申请号：CN201310154296.8

申请日：2013-04-28

Applicant: 暨南大学

Inventor： 孟小华 ,  郑冬琴 ,  宁蓉 ,  钟伟荣

IPC: G06F19/00 ,  G06T1/20

Abstract: 本发明公开了一种基于GPU并行运算的碳纳米管分子动力学仿真方法，包括以下步骤：1)由数据库文件构造由碳纳米管和C60分子组成的碳纳米管系统模型；2)C60分子受力，在平衡位置上来回振动，当C60分子处于平衡状态时，使碳纳米管管壁上的碳粒子和C60分子的位置和速度发生变化；3)在CUDA平台上将碳纳米管分割成多层计算单元，采用CPU遍历计算单元进行轮转计算得到可并行运算队列，调度GPU的流处理单元进行并行运算和处理；4)重复执行步骤3)，最终输出C60分子随着模拟时间的运行轨迹，并描绘碳纳米管内随着能量传递的温度变化曲线图，完成仿真过程。本发明极大地提高分子动力学仿真的运算效率。

公开(公告)号：CN103279645A

公开(公告)日：2013-09-04

申请号：CN201310154296.8

申请日：2013-04-28

Applicant: 暨南大学

Inventor： 孟小华 ,  郑冬琴 ,  宁蓉 ,  钟伟荣

IPC: G06F19/00 ,  G06T1/20

Abstract: 本发明公开了一种基于GPU并行运算的碳纳米管分子动力学仿真方法，包括以下步骤：1)由数据库文件构造由碳纳米管和C60分子组成的碳纳米管系统模型；2)C60分子受力，在平衡位置上来回振动，当C60分子处于平衡状态时，使碳纳米管管壁上的碳粒子和C60分子的位置和速度发生变化；3)在CUDA平台上将碳纳米管分割成多层计算单元，采用CPU遍历计算单元进行轮转计算得到可并行运算队列，调度GPU的流处理单元进行并行运算和处理；4)重复执行步骤3)，最终输出C60分子随着模拟时间的运行轨迹，并描绘碳纳米管内随着能量传递的温度变化曲线图，完成仿真过程。本发明极大地提高分子动力学仿真的运算效率。