公开(公告)号：CN107460254B

公开(公告)日：2020-02-14

申请号：CN201710928978.8

申请日：2017-10-09

Applicant: 扬州大学

Inventor： 宋成义 ,  陈才 ,  王伟 ,  杨昆仑 ,  张丽 ,  沈丹 ,  王赛赛 ,  王宵燕 ,  高波 ,  赵旭庭 ,  周春宝 ,  陶勇 ,  倪黎纲

IPC: C12Q1/6888 ,  G16B20/20

Abstract: 本发明涉及分子生物学和生物信息学领域，具体涉及一种基于猪LINE1转座子插入多态性研发新型分子标记的方法。该方法是利用LINE1的5’端核苷酸序列或3’端核苷酸序列作为查询序列，在猪公开的基因组寻找插入位点；对寻找到的LINE1的每个插入位点，分别向上、下游延伸300‑500个核苷酸序列，然后下载每条序列；获得的序列去除冗余；根据获得的序列信息设计检测引物，再利用所得的待验证分子标记引物PCR扩增不同品种，或同一品种不同个体基因组样品，选取能清晰扩出条带且有多态性的引物组合，获得分子标记。本发明方法可以为猪的品系鉴定，育种中的标记辅助选择提供有用的分子标记。

公开(公告)号：CN107460254A

公开(公告)日：2017-12-12

申请号：CN201710928978.8

申请日：2017-10-09

Applicant: 扬州大学

Inventor： 宋成义 ,  陈才 ,  王伟 ,  杨昆仑 ,  张丽 ,  沈丹 ,  王赛赛 ,  王宵燕 ,  高波 ,  赵旭庭 ,  周春宝 ,  陶勇 ,  倪黎纲

IPC: C12Q1/68 ,  C12N15/10

Abstract: 本发明涉及分子生物学和生物信息学领域，具体涉及一种基于猪LINE1转座子插入多态性研发新型分子标记的方法。该方法是利用LINE1的5’端核苷酸序列或3’端核苷酸序列作为查询序列，在猪公开的基因组寻找插入位点；对寻找到的LINE1的每个插入位点，分别向上、下游延伸300-500个核苷酸序列，然后下载每条序列；获得的序列去除冗余；根据获得的序列信息设计检测引物，再利用所得的待验证分子标记引物PCR扩增不同品种，或同一品种不同个体基因组样品，选取能清晰扩出条带且有多态性的引物组合，获得分子标记。本发明方法可以为猪的品系鉴定，育种中的标记辅助选择提供有用的分子标记。