水稻GS3突变基因、其分子标记及用途

    公开(公告)号:CN111849999B

    公开(公告)日:2022-11-29

    申请号:CN201911015264.3

    申请日:2019-10-24

    Applicant: 扬州大学

    Abstract: 本发明公开了一种水稻GS3突变基因、其分子标记及用途。水稻GS3突变基因,为水稻GS3基因第5932个碱基之后的三个CTC碱基缺失得到,该突变位点位于第5外显子。本发明还公开针对其的分子标记,并进一步公开了包含所述分子标记的分子标记组合,并提供了用途。本发明发现并鉴定了水稻GS3基因第五外显子调控粒型的关键变异,3bp缺失突变参与水稻粒型性状的调控,该突变可以作为今后粒型改良育种的另一筛选靶标。本发明开发了有效的dCaps标记及分子标记组合,可以用于水稻粒型的区分、选择、品种鉴定、水稻育种等方向。

    一种鉴定水稻粗杆大穗位点ipa1-2D和ipa1-1D的引物及方法

    公开(公告)号:CN112481411A

    公开(公告)日:2021-03-12

    申请号:CN202011547600.1

    申请日:2020-12-24

    Applicant: 扬州大学

    Abstract: 本发明公开了一种鉴定水稻粗杆大穗位点ipa1‑2D和ipa1‑1D的引物,属于水稻品种鉴定技术领域。本发明针对ipa1‑2D位点的两个SNP,我们设计了一种分别识别两个SNP的三引物组合设计,所述的引物序列如SEQ ID NO.1~13所示的引物,这些引物组合在一轮PCR中即可完成基因型鉴定,降低了时间、劳力及试剂成本,且比四引物节省了引物合成费用,其中七条引物的不同组合可获得三套ipa1‑2D鉴定模块,满足不同类型群体的鉴定需求。这些引物在进行大量群体鉴定方面具有巨大优势,在今后水稻超级杂交稻的分子设计育种中具有良好的应用前景。

    一种鉴别水稻GS5基因和GLW7基因类型的引物及其应用

    公开(公告)号:CN110894542A

    公开(公告)日:2020-03-20

    申请号:CN201911402905.0

    申请日:2019-12-31

    Applicant: 扬州大学

    Abstract: 本发明公开了一种鉴别GS5基因和GLW7基因类型的引物及其应用,属于水稻品种鉴定技术领域。本发明通过将水稻GS5基因和GLW7基因简的单重复序列转变为酶切分子标记来鉴别GS5基因和GLW7基因类型,其核苷酸序列如SEQ ID NO.:1~6所示。利用本发明的分子标记,可以准确鉴定GS5和GLW7基因的有利变异类型,加快育种筛选效率及进程;本发明设计的酶切分子标记扩增效果好,且所选酶是价格较低的常用酶,可极大降低鉴定成本,适用于大量品种基因型分析。

    一种筛选水稻生育期的方法

    公开(公告)号:CN113981130A

    公开(公告)日:2022-01-28

    申请号:CN202111443502.8

    申请日:2021-11-30

    Applicant: 扬州大学

    Abstract: 本发明提供了一种筛选水稻生育期的方法,其包括如下步骤:准备扩增模板、准备扩增体系、PCR、琼脂糖凝胶电泳、拍照比对。本发明通过遗传分离群体发现两种Hd1的不同等位变异,与野生型相比这两种突变等位都能够显著提前生育期,针对这两种变异类型,我们分别设计了两组四引物标记,实现了利用PCR结合凝胶电泳方法快速鉴定两种变异,并证明所用引物可有效用于水稻生育期性状的追踪。

    水稻GS3突变基因、其分子标记及用途

    公开(公告)号:CN111849999A

    公开(公告)日:2020-10-30

    申请号:CN201911015264.3

    申请日:2019-10-24

    Applicant: 扬州大学

    Abstract: 本发明公开了一种水稻GS3突变基因、其分子标记及用途。水稻GS3突变基因,为水稻GS3基因第5932个碱基之后的三个CTC碱基缺失得到,该突变位点位于第5外显子。本发明还公开针对其的分子标记,并进一步公开了包含所述分子标记的分子标记组合,并提供了用途。本发明发现并鉴定了水稻GS3基因第五外显子调控粒型的关键变异,3bp缺失突变参与水稻粒型性状的调控,该突变可以作为今后粒型改良育种的另一筛选靶标。本发明开发了有效的dCaps标记及分子标记组合,可以用于水稻粒型的区分、选择、品种鉴定、水稻育种等方向。

    一种高效鉴定粒重基因GW5不同等位的引物组合及鉴定方法和应用

    公开(公告)号:CN114058732A

    公开(公告)日:2022-02-18

    申请号:CN202111485079.8

    申请日:2021-12-07

    Applicant: 扬州大学

    Abstract: 本发明提供了一种高效鉴定粒重基因GW5不同等位的引物组合及鉴定方法和应用,所述引物组合包括第一引物组和第二引物组,所述第一引物组包括序列号为SEQ ID NO.1的GW5_YN_F、序列号为SEQ ID NO.2的GW5_YN_R1、序列号为SEQ ID NO.3的GW5_YN_R2;所述第二引物组包括序列号为SEQ ID NO.4的GW5_YZ_F、序列号为SEQ ID NO.5的GW5_YZ_R1、序列号为SEQ ID NO.6的GW5_YZ_R2。本发明构建的引物组合鉴定类型能够实现同时鉴定粒重基因GW5的三种等位,是一种全新的标记组合类型,相比之前的鉴定标记,该标记组合的鉴定效率成倍增加,在节约成本、提高效率方面有巨大优势。

    水稻大粒基因功能标记及应用

    公开(公告)号:CN110747288A

    公开(公告)日:2020-02-04

    申请号:CN201911112887.2

    申请日:2019-11-14

    Applicant: 扬州大学

    Abstract: 本发明公开了一种水稻大粒基因功能标记及应用。功能标记选自GS2功能标记、GW2功能标记、GL3.1功能标记、GW2启动子标记中的一种或几种,其中,GS2功能标记为针对GS2基因第三外显子的TC/AA突变开发的dCaps标记;GW2功能标记为针对GW2基因第五外显子的核苷酸A缺失突变开发的dCaps标记;GL3.1功能标记为针对GL3.1基因第十外显子的单碱基C/A突变开发的dCaps标记;GW2启动子标记为针对GW2翻译起始位点上游858bp处T/A突变开发的dCaps标记。本发明针对水稻大粒基因关键变异位点,开发了有效的dCaps标记,可以有效鉴定大粒水稻种质,应用于水稻分子育种。

    一种筛选水稻生育期的方法

    公开(公告)号:CN113981130B

    公开(公告)日:2024-04-26

    申请号:CN202111443502.8

    申请日:2021-11-30

    Applicant: 扬州大学

    Abstract: 本发明提供了一种筛选水稻生育期的方法,其包括如下步骤:准备扩增模板、准备扩增体系、PCR、琼脂糖凝胶电泳、拍照比对。本发明通过遗传分离群体发现两种Hd1的不同等位变异,与野生型相比这两种突变等位都能够显著提前生育期,针对这两种变异类型,我们分别设计了两组四引物标记,实现了利用PCR结合凝胶电泳方法快速鉴定两种变异,并证明所用引物可有效用于水稻生育期性状的追踪。

    一种高效鉴定稻花香香米基因的引物组合物及其方法

    公开(公告)号:CN114107544A

    公开(公告)日:2022-03-01

    申请号:CN202111437264.X

    申请日:2021-11-30

    Applicant: 扬州大学

    Abstract: 本发明涉及一种高效鉴定稻花香香米基因的引物组合物及方法,前期通过测序,发现“稻花香”品种的BADH2基因存在8bp序列缺失,该基因突变会导致芳香物质积累,应是导致稻花香品种香米产生的主要原因。通过本发明,本发明设计了一种四引物标记,能够高通量且低成本鉴定该序列缺失,实现香稻品种的快速鉴定及选育。目前水稻育种对品质提升的需求越来越高,但在育种中如何有效追踪大米香味特征还是个难点,而本发明为上述问题提供了一种简单且高效的方法,具有良好的推广应用潜力,预期将产生较好的经济效益。

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