公开(公告)号：CN119207582A

公开(公告)日：2024-12-27

申请号：CN202411264805.7

申请日：2024-09-10

Applicant: 成都信息工程大学 ,  四川省计算机研究院

Inventor： 张永清 ,  周治淦 ,  黄渝璐 ,  邓朝晖 ,  何嘉 ,  王茂丞 ,  毛欣宇 ,  王紫轩

IPC: G16B40/00 ,  G16B40/30 ,  G16B25/10 ,  G16B50/30 ,  G16B45/00 ,  G06N5/04 ,  G06N3/0455 ,  G06N3/096 ,  G06N3/0985 ,  G06F18/2133 ,  G06F18/23 ,  G06F18/27 ,  G06N3/048

Abstract: 本发明公开了一种基于对比学习的单细胞多组学基因调控网络推理方法，属于生物信息技术领域，其包括获取单细胞RNA测序数据和单细胞染色质可及性数据，并进行预处理得到多组学数据的先验网络；将先验调控网络加载成图结构，并将图结构转换为特征空间矩阵；计算图结构中每条边上两个结点的皮尔逊相关系数，当其大于预设阈值时，作为结点对，将结点对和其对应的特征向量和隐藏向量存储至数据集中；将数据集分成若干批次随机输入对比学习模型，得到每个结点的结点类型、结点对的配对程度和结点特征重建向量；采用调控网络解释器提取结点特征重建向量中两个结点在特征空间中的映射，并基于映射计算结点的结构熵，以此确定结点是否为关键结点。