日志记录的分子事件的时机

    公开(公告)号:CN109415724B

    公开(公告)日:2022-07-15

    申请号:CN201780041175.9

    申请日:2017-06-23

    Inventor: K·K·甘贾姆

    Abstract: 通过在多核苷酸中产生双链断裂(“DSB”)并通过采用同源定向修复(“HDR”)来修复该DSB而插入新的多核苷酸序列的过程,将细胞经历的分子事件和那些事件的时机指示物的日志存储在现有多核苷酸中。新的多核苷酸序列的存在、顺序和数量提供事件和那些事件的时机的日志。用于产生DSB和/或采用HDR的修复的细胞机制由细胞内或细胞外信号调节。当在细胞的DNA中产生该日志时,变化可以遗传地传递到该细胞的后续世代。细胞信号和插入的HDR模板的序列之间的关联允许识别细胞经历的事件和时机。

    通过迭代DNA编辑的存储
    3.
    发明公开

    公开(公告)号:CN109477130A

    公开(公告)日:2019-03-15

    申请号:CN201780041255.4

    申请日:2017-06-15

    Inventor: K·K·甘贾姆

    Abstract: 通过在dsDNA中产生断裂并用同源修复模板修复断裂来增加新的DNA的迭代过程将信息存储在现有DNA中。添加到dsDNA中的断裂中的DNA序列的顺序和序列可编码二进制数据。通过使用情境依赖性编码方案,三个独特的同源修复模板可编码无限的数位。当现有DNA在细胞中时,变化可遗传地传递给后续细胞世代。同源修复模板的合成可以是在启动子和操纵基因的控制下。细胞内或细胞外信号可以调节同源修复模板的合成。

    通过迭代DNA编辑的存储
    4.
    发明授权

    公开(公告)号:CN109477130B

    公开(公告)日:2022-08-30

    申请号:CN201780041255.4

    申请日:2017-06-15

    Inventor: K·K·甘贾姆

    Abstract: 通过在dsDNA中产生断裂并用同源修复模板修复断裂来增加新的DNA的迭代过程将信息存储在现有DNA中。添加到dsDNA中的断裂中的DNA序列的顺序和序列可编码二进制数据。通过使用情境依赖性编码方案,三个独特的同源修复模板可编码无限的数位。当现有DNA在细胞中时,变化可遗传地传递给后续细胞世代。同源修复模板的合成可以是在启动子和操纵基因的控制下。细胞内或细胞外信号可以调节同源修复模板的合成。

    分子状态机
    6.
    发明公开

    公开(公告)号:CN109415725A

    公开(公告)日:2019-03-01

    申请号:CN201780041484.6

    申请日:2017-06-29

    Inventor: K·K·甘贾姆

    Abstract: 通过设计细胞以使用特异性同源定向修复(“HDR”)模板,基于细胞的当前“状态”修复多核苷酸中的双链断裂,在细胞中实施分子状态机。可以通过细胞中分子的存在或通过细胞的多核苷酸中特定切割位点的可用性来建立状态。可以使用不同的HDR模板或不同的核酸酶来基于状态执行HDR。当状态改变时,相同的信号或事件将导致将不同的HDR模板引入细胞的现有多核苷酸中。可以使用细胞内部或外部的信号改变细胞的状态。细胞可以基于状态产生分子事件的日志,存储二进制数据,或执行其他合成生物学/分子计算功能。

    日志记录的分子事件的时机

    公开(公告)号:CN109415724A

    公开(公告)日:2019-03-01

    申请号:CN201780041175.9

    申请日:2017-06-23

    Inventor: K·K·甘贾姆

    Abstract: 通过在多核苷酸中产生双链断裂(“DSB”)并通过采用同源定向修复(“HDR”)来修复该DSB而插入新的多核苷酸序列的过程,将细胞经历的分子事件和那些事件的时机指示物的日志存储在现有多核苷酸中。新的多核苷酸序列的存在、顺序和数量提供事件和那些事件的时机的日志。用于产生DSB和/或采用HDR的修复的细胞机制由细胞内或细胞外信号调节。当在细胞的DNA中产生该日志时,变化可以遗传地传递到该细胞的后续世代。细胞信号和插入的HDR模板的序列之间的关联允许识别细胞经历的事件和时机。

    关系DNA操作
    10.
    发明授权

    公开(公告)号:CN107750361B

    公开(公告)日:2021-03-19

    申请号:CN201680035799.5

    申请日:2016-06-14

    Abstract: 一种通过存储在DNA分子中编码的信息而实现的数据库提供了高信息密度,但是信息比常规电子存储介质更难获取。关系数据库是通过使用多个相关表来组织信息的一种方式。在关系数据库上执行关系代数操作,以定位和操纵信息。本公开提供了在使用DNA分子来存储信息的关系数据库上,实现关系代数操作的技术。本公开的技术涉及用于存储信息的DNA分子的结构以及涉及关系代数操作和DNA分子操作之间的相关性。

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