辅助检测肺癌体细胞EGFR基因突变的甲基化生物标记物、试剂盒及方法

    公开(公告)号:CN117660640A

    公开(公告)日:2024-03-08

    申请号:CN202211699904.9

    申请日:2022-12-28

    Abstract: 本发明公开了一种辅助检测肺癌体细胞EGFR基因突变的甲基化生物标记物、试剂盒及方法,所述甲基化生物标记物包括chr19:13198677‑13198878、chr6:25882281‑25882482、chr6:25882382‑25882583、chr2:232545785‑232545986、chr10:94303998‑94304199中的任意至少一种。本发明的发明人发现包括chr19:13198677‑13198878等在内的共224种DNA甲基化区域,能辅助检测肺癌体细胞样本中EGFR基因是否发生有害突变,同时还能克服单个DNA甲基化信号低的问题,并提高检测的灵敏度和特异性,从而为肺癌患者的临床靶向用药治疗等方面提供更为有效地辅助检测服务。

    用于检测肺结节良恶性的甲基化分子标记物组合和应用

    公开(公告)号:CN114645043B

    公开(公告)日:2022-12-09

    申请号:CN202111539702.3

    申请日:2021-12-15

    Abstract: 本发明提供了用于检测肺结节良恶性的DNA甲基化分子标记物组合,所述DNA甲基化分子标记物组合为所述DNA甲基化分子标记物为选自SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.5所示序列或其完全互补序列中的任意两种以上的组合;或为选自SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.5所示序列或其完全互补序列的全长的至少55%的连续片段中的任意两种以上的组合。本发明还提供了上述DNA甲基化分子标记物组合的检测试剂盒和检测方法。所述DNA甲基化分子标记物组合与肺癌高度相关,对肺结节良恶性的检测具有高度灵敏度和特异性,能提高恶性肺结节的检出率,降低检出的假阳性率。所述试剂盒中的引物和探针克服了多个引物和探针在进行多重PCR扩增和检测时存在相互干扰的缺点,定量性能与单个区域定量等同。

    用于检测肺结节良恶性的甲基化分子标记物组合和应用

    公开(公告)号:CN114645043A

    公开(公告)日:2022-06-21

    申请号:CN202111539702.3

    申请日:2021-12-15

    Abstract: 本发明提供了用于检测肺结节良恶性的DNA甲基化分子标记物组合,所述DNA甲基化分子标记物组合为所述DNA甲基化分子标记物为选自SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.5所示序列或其完全互补序列中的任意两种以上的组合;或为选自SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.5所示序列或其完全互补序列的全长的至少55%的连续片段中的任意两种以上的组合。本发明还提供了上述DNA甲基化分子标记物组合的检测试剂盒和检测方法。所述DNA甲基化分子标记物组合与肺癌高度相关,对肺结节良恶性的检测具有高度灵敏度和特异性,能提高恶性肺结节的检出率,降低检出的假阳性率。所述试剂盒中的引物和探针克服了多个引物和探针在进行多重PCR扩增和检测时存在相互干扰的缺点,定量性能与单个区域定量等同。

    用于检测肺结节良恶性的甲基化分子标记物或其组合和应用

    公开(公告)号:CN114645087A

    公开(公告)日:2022-06-21

    申请号:CN202111509796.X

    申请日:2021-12-10

    Abstract: 本发明提供了用于检测肺结节良恶性的DNA甲基化分子标记物或其组合,所述DNA甲基化分子标记物或其组合为选自SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.19所示序列或其全长的至少55%的连续片段中的任意一种或两种以上的组合;或为选自SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.19所示序列的完全互补序列或其全长的至少55%的连续片段中的任意一种或两种以上的组合。其中特别是其中的SEQ ID NO.9具有对肺结节良恶性检测的较高特异性。本发明还提供了上述DNA甲基化分子标记物的检测试剂盒和检测方法。所述DNA甲基化分子标记物与肺癌高度相关,尤其是组合使用,可以进一步提高对肺结节良恶性的检测的灵敏度和特异性,提高恶性肺结节的检出率,降低检出的假阳性率。所述试剂盒中的引物和探针克服了多个引物和探针在进行多重PCR扩增和检测时存在相互干扰的缺点,定量性能与单个区域定量等同。

    甲基化水平的向量化表征、特定测序区间检测方法和装置

    公开(公告)号:CN111627499A

    公开(公告)日:2020-09-04

    申请号:CN202010462199.5

    申请日:2020-05-27

    Inventor: 杨昊 蒋泽宇

    Abstract: 本申请涉及一种甲基化水平的向量化表征、特定测序区间的检测、特定测序区间的记录方法、装置、计算机设备和可读存储介质。其中甲基化水平的向量化表征方法和装置,可以通过获取样本的甲基化信息,确定阅读区间各类测序结果的Reads数目,将滑动窗口在阅读区间按照滑动步长从滑动,以获取各次窗口读取过程中,滑动窗口的各个序列组合的出现次数,进而确定各个甲基化测序区间在各次窗口读取过程的次数向量,将各个次数向量拼接为相应甲基化测序区间的甲基化向量,使所确定的甲基化向量中的每个向量元素与检测样本中各个甲基化测序区间的序列组合一一对应,能够对检测样本中各个甲基化测序区间的甲基化信息进行全面表征。

    外周血DNA中辅助检测肺结节良恶性的甲基化生物标记物组合及其应用

    公开(公告)号:CN117660642A

    公开(公告)日:2024-03-08

    申请号:CN202310775742.0

    申请日:2023-06-28

    Abstract: 本发明提供了外周血DNA中辅助检测肺结节良恶性的甲基化生物标记物的组合及其应用,所述甲基化生物标志物组合包括以下标记物:chr11:133938689‑133939345,chr19:10691814‑10692015,chr11:133938595‑133938877,chr5:175299506‑175299707,chr17:46655168‑46655474,chr7:142494474‑142495178,chr20:47444770‑47445043,chr7:87230068‑87230269,chr7:87230006‑87230207,chr8:72756691‑72756892,chr17:46655603‑46655876等。本发明发现最优的11‑marker、92‑marker组合以及作为备选的13‑marker、57‑marker、75‑marker组合等组合,其能有效地辅助检测肺结节良恶性,从而为肺癌患者制定合理诊疗方案等方面提供更为有效地辅助检测服务,还可以更全面分析肺癌发生、发展中的甲基化变化,应用于肺癌早期筛查、辅助诊断、疗效评估和复发监测等阶段。

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