公开(公告)号：CN113136443A

公开(公告)日：2021-07-20

申请号：CN202110501851.4

申请日：2021-05-08

Applicant: 广东省科学院微生物研究所(广东省微生物分析检测中心)

Inventor： 丁郁 ,  张俊卉 ,  周桓 ,  吴清平 ,  王涓 ,  朱振军 ,  张菊梅 ,  叶青华 ,  陈谋通 ,  薛亮 ,  吴诗 ,  曾海燕 ,  庞锐 ,  张淑红 ,  杨小鹃

IPC: C12Q1/689 ,  C12Q1/686 ,  C12Q1/04 ,  C12N15/11 ,  C12R1/085 ,  C12R1/07

Abstract: 本发明公开了一种快速鉴定蜡样芽胞杆菌和苏云金芽胞杆菌的核酸检测方法。本发明收集尽量多的公共数据库和前期研究中蜡样芽胞杆菌族群菌株基因组，对已有的菌株分类信息进行真实性确证分析，比较基因组和泛基因组方法挖掘公共数据库中蜡样芽胞杆菌(Bacillus cereus)和苏云金芽胞杆菌(Bacillus thuringiensis)可区分靶标，利用本组实验菌株验证和筛选区分蜡样芽胞杆菌和苏云金芽胞杆菌的特征性分子靶标，包括选取分子靶标ispD基因序列中不同的SNP位点设计引物，引物对的筛选，分别以蜡样芽胞杆菌和苏云金芽胞杆菌为模板进行HRM实验，获得对应菌株的特征性熔解曲线信息，实现对蜡样芽胞杆菌和苏云金芽胞杆菌的准确鉴别。

公开(公告)号：CN113219115A

公开(公告)日：2021-08-06

申请号：CN202110541420.0

申请日：2021-05-18

Applicant: 广东省科学院微生物研究所(广东省微生物分析检测中心)

Inventor： 吴清平 ,  陈敏玲 ,  丁郁 ,  王涓 ,  张菊梅 ,  张俊卉 ,  周桓 ,  余树波 ,  陈谋通 ,  薛亮 ,  叶青华 ,  韦献虎 ,  张友雄

IPC: G01N30/06 ,  G01N30/72

Abstract: 本发明公开了一种基于MALDI‑TOFMS的蜡样芽胞杆菌和苏云金芽胞杆菌快速鉴定方法。它是以50S核糖体蛋白L30、50S核糖体蛋白L31typeB和30S核糖体蛋白S20作为特征蛋白。本发明利用蜡样芽胞杆菌和苏云金芽胞杆菌的全基因组测序信息指导MALDI‑TOFMS特征峰的筛选和鉴定，获得能准确区分蜡样芽胞杆菌和苏云金芽胞杆菌的MALDI‑TOFMS特征峰，结果准确可靠，为MALDI‑TOFMS区分近缘物种提供思路。

公开(公告)号：CN113136443B

公开(公告)日：2021-12-21

申请号：CN202110501851.4

申请日：2021-05-08

Applicant: 广东省科学院微生物研究所(广东省微生物分析检测中心)

Inventor： 丁郁 ,  张俊卉 ,  周桓 ,  吴清平 ,  王涓 ,  朱振军 ,  张菊梅 ,  叶青华 ,  陈谋通 ,  薛亮 ,  吴诗 ,  曾海燕 ,  庞锐 ,  张淑红 ,  杨小鹃

IPC: C12Q1/689 ,  C12Q1/686 ,  C12Q1/04 ,  C12N15/11 ,  C12R1/085 ,  C12R1/07

Abstract: 本发明公开了一种快速鉴定蜡样芽胞杆菌和苏云金芽胞杆菌的核酸检测方法。本发明收集尽量多的公共数据库和前期研究中蜡样芽胞杆菌族群菌株基因组，对已有的菌株分类信息进行真实性确证分析，比较基因组和泛基因组方法挖掘公共数据库中蜡样芽胞杆菌(Bacillus cereus)和苏云金芽胞杆菌(Bacillus thuringiensis)可区分靶标，利用本组实验菌株验证和筛选区分蜡样芽胞杆菌和苏云金芽胞杆菌的特征性分子靶标，包括选取分子靶标ispD基因序列中不同的SNP位点设计引物，引物对的筛选，分别以蜡样芽胞杆菌和苏云金芽胞杆菌为模板进行HRM实验，获得对应菌株的特征性熔解曲线信息，实现对蜡样芽胞杆菌和苏云金芽胞杆菌的准确鉴别。