基于自适应层数的GCN-LSTM重构时序基因调控网络

    公开(公告)号:CN119811484A

    公开(公告)日:2025-04-11

    申请号:CN202411734998.8

    申请日:2024-11-29

    Applicant: 安徽大学

    Abstract: 本发明公开了一种基于自适应层数的GCN‑LSTM重构时序基因调控网络,包括:使用不同时间点的基因表达矩阵和先验的基因调控网络在自适应层数的GCN中提取到对应的不同时间点的基因特征;不同时间点的基因特征输入LSTM获取下一时间点的基因特征;基于下一时间点的基因特征和先验的基因调控网络在受重力启发的GAE当中预测得到下一时间点的有向的基因调控网络。本发明采用自适应层数的GCN,可以根据数据集的大小不同来自适应GCN层数;借助LSTM学习时间点之间的更加丰富的基因特征,采用受重力启发的图自编码器(GAE)获取有向的基因调控网络(GRN),具有更高的细胞类型特异性推理准确性。

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