一种短链ssDNA的测序文库构建方法、测序方法及应用

    公开(公告)号:CN119614676A

    公开(公告)日:2025-03-14

    申请号:CN202510149519.4

    申请日:2025-02-11

    Abstract: 本发明涉及DNA测序领域,具体地,涉及一种短链ssDNA的测序文库构建方法、测序方法及应用。其中,所述短链ssDNA的测序文库构建方法,包括步骤:添加多聚核苷酸尾步骤;其中,所述加尾短链ssDNA长度不小于100nt;获得环化单链DNA步骤:将加尾短链ssDNA处理后连接成环,随后进行环状DNA的产物纯化,并以纯化产物为模板,进行扩增;DNA链片段化步骤:将获得环化单链DNA步骤的产物利用核酸内切酶使其片段化,并建立测序文库。采用本申请所述的技术方案,通过延长短链ssDNA并使其成环,解决了现有技术手段中短ssDNA直接建库测序不满足三代测序条件、三代测序准确率低等技术问题,实现了特殊ssDNA的建库。

    一种DNA合成装置
    2.
    发明公开

    公开(公告)号:CN115125130A

    公开(公告)日:2022-09-30

    申请号:CN202210819360.9

    申请日:2022-07-13

    Inventor: 逯晓云 吕文丽

    Abstract: 本发明涉及一种DNA合成装置,包括:储液池组,所述储液池组包括若干个储液瓶;注射泵组,所述注射泵组包括若干个注射泵,所述注射泵的输入端与对应的所述储液瓶之间通过管路连接;多通道切换阀,若干个所述注射泵的输出端与所述输入口之间通过管道连通;微流控芯片,所述微流控芯片输入端与所述多通道切换阀的输出口之间通过管路连通;废液瓶,所述废液瓶与所述微流控芯片的输出端之间通过管路连通;PLC控制器,所述PLC控制器与所述注射泵组电连接,用于控制每一个所述注射泵和多通道切换阀动作。所述DNA合成装置优化了设备内部电路和控制系统,利用注射泵精准控制试剂耗材的量,节约资源,避免了液体之间的交叉污染。

    一种用于酶促DNA合成的试剂盒及其应用

    公开(公告)号:CN116004746A

    公开(公告)日:2023-04-25

    申请号:CN202210888941.8

    申请日:2022-07-27

    Inventor: 逯晓云 吕文丽

    Abstract: 本申请公开一种用于酶促DNA合成的试剂盒及其应用,属于DNA合成领域。本发明公开了一种用于酶促DNA合成的试剂盒,所述试剂盒包括芯片、起始链和末端脱氧核苷酸转移酶,所述芯片含有探针,所述探针为单链DNA分子,所述探针的3'末端被氨基修饰,所述探针包括柔性臂区和与所述起始链结合的结合区,所述柔性臂区由6‑12个T连接而成,所述结合区由20‑30个核苷酸组成,所述结合区的核苷酸序列与所述起始链的5'端反向互补。本发明提供了酶促DNA合成的芯片,该芯片解离效率高、可重复使用,对酶促DNA合成领域具有重要的意义。

    一种短链ssDNA的测序文库构建方法、测序方法及应用

    公开(公告)号:CN119614677A

    公开(公告)日:2025-03-14

    申请号:CN202510156634.4

    申请日:2025-02-13

    Abstract: 本发明涉及DNA测序领域,具体地,涉及一种短链ssDNA的测序文库构建方法、测序方法及应用。其中,所述短链ssDNA的测序文库构建方法,包括步骤:添加多聚核苷酸尾步骤,以所述短链ssDNA为模板,利用末端脱氧核苷酸转移酶进行酶反应,在短链ssDNA的3'末端加入多聚核苷酸尾,获得加尾短链ssDNA;短链ssDNA的PCR扩增步骤;末端修复步骤;连接接头步骤,以末端修复步骤所得产物为模板,使用连接酶进行反应,得到带接头的模板,并对其进行纯化;dsDNA的PCR富集纯化步骤,以连接接头步骤所得纯化产物为模板,设计第二引物进行PCR富集、纯化,得到测序文库。本申请的短链ssDNA测序文库构建方法,弥补了现有技术存在的不足,不再受限于固定状态的ssDNA,实现了特殊ssDNA的建库。

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