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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN111724855A
公开(公告)日：2020-09-29
申请号：CN202010378184.0
申请日：2020-05-07
Applicant: 大连理工大学
Abstract: 本发明提供一种基于最小生成树Prim的蛋白质复合物识别方法。本发明方法，包括：S1、计算蛋白质相互作用关系网中蛋白质节点的度，识别蛋白质相互作用关系网的蛋白质簇；S2、采用Prim生成树，对识别出的蛋白质簇进行扩展；S3、采用内聚性方法，判断每次扩展后的蛋白质簇的内聚性；S4、若蛋白质簇的内聚性增加，则继续扩展；若蛋白质簇的内聚性减小，则撤回此次扩展，并将此次扩展前的蛋白质节点加入到蛋白质簇中，得到蛋白质复合物集合。本发明提出的蛋白质识别方法能够对蛋白质复合物进行精准预测，识别正确率高。精准的蛋白质复合物识别能够有效的识别导致疾病的蛋白质复合物，为疾病的根源提供线索，为识别疾病基因和研发新的药物靶点提供依据。
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公开(公告)号：CN111724855B
公开(公告)日：2023-03-10
申请号：CN202010378184.0
申请日：2020-05-07
Applicant: 大连理工大学
Abstract: 本发明提供一种基于最小生成树Prim的蛋白质复合物识别方法。本发明方法，包括：S1、计算蛋白质相互作用关系网中蛋白质节点的度，识别蛋白质相互作用关系网的蛋白质簇；S2、采用Prim生成树，对识别出的蛋白质簇进行扩展；S3、采用内聚性方法，判断每次扩展后的蛋白质簇的内聚性；S4、若蛋白质簇的内聚性增加，则继续扩展；若蛋白质簇的内聚性减小，则撤回此次扩展，并将此次扩展前的蛋白质节点加入到蛋白质簇中，得到蛋白质复合物集合。本发明提出的蛋白质识别方法能够对蛋白质复合物进行精准预测，识别正确率高。精准的蛋白质复合物识别能够有效的识别导致疾病的蛋白质复合物，为疾病的根源提供线索，为识别疾病基因和研发新的药物靶点提供依据。
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公开(公告)号：CN111667886A
公开(公告)日：2020-09-15
申请号：CN202010324055.3
申请日：2020-04-22
Applicant: 大连理工大学
Abstract: 本发明提供一种动态蛋白质复合物识别方法。本发明方法，结合基因表达数据和静态PPI网络构建动态蛋白质相互作用网络；基于马尔可夫聚类对每一时刻的动态蛋白质相互作用网络进行聚类；通过核心附着结构对聚类结果进行优化，合并具有核心蛋白质的聚类和包含附着蛋白质的聚类；滤除高度重叠的蛋白质复合物，输出最终蛋白质复合物集合。本发明方法不但可以抑制小类的产生，而且能够识别重叠的蛋白质。本发明提出了从动态蛋白质相互作用网络中识别蛋白质复合物的计算方法，更符合实际生物过程的PPI网络，提供更准确的蛋白质复合物识别结果。
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公开(公告)号：CN111667886B
公开(公告)日：2023-04-18
申请号：CN202010324055.3
申请日：2020-04-22
Applicant: 大连理工大学
Abstract: 本发明提供一种动态蛋白质复合物识别方法。本发明方法，结合基因表达数据和静态PPI网络构建动态蛋白质相互作用网络；基于马尔可夫聚类对每一时刻的动态蛋白质相互作用网络进行聚类；通过核心附着结构对聚类结果进行优化，合并具有核心蛋白质的聚类和包含附着蛋白质的聚类；滤除高度重叠的蛋白质复合物，输出最终蛋白质复合物集合。本发明方法不但可以抑制小类的产生，而且能够识别重叠的蛋白质。本发明提出了从动态蛋白质相互作用网络中识别蛋白质复合物的计算方法，更符合实际生物过程的PPI网络，提供更准确的蛋白质复合物识别结果。
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公开(公告)号：CN110992223A
公开(公告)日：2020-04-10
申请号：CN201911143803.1
申请日：2019-11-20
Applicant: 大连理工大学
Abstract: 本发明提供一种在线评测系统的题目推荐方法。本发明方法，包括：S1、提取在线评测系统数据库中的用户提交题目的三元组；S2、建立用户题目关联矩阵；S3、通过用户解出题目的情况，计算用户之间的相似性；S4、计算推荐题目得分；S5、根据题目得分，对题目进行排序，根据题目排序推荐给用户适合做的题目。本发明的技术方案可应用于程序设计课程教学和竞赛的在线评测系统中，能够推荐给用户适合其编程能力的题目，避免盲目做题而导致大量错误提交。
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