公开(公告)号：CN113584176A

公开(公告)日：2021-11-02

申请号：CN202111031784.0

申请日：2021-09-03

Applicant: 复旦大学附属中山医院

Inventor： 曾德军 ,  单光耀 ,  卞赟艺 ,  胡正阳 ,  易彦均 ,  云丽娅 ,  詹成 ,  林宗武

IPC: C12Q1/6886 ,  G06Q10/04 ,  G16B20/50

Abstract: 本发明公开了一种用于检测肺腺癌细胞中TP53通路相关基因突变的基因组合物以及预测模型和方法。本发明通过运用RNA测序、Lasso回归和二分类Logistic回归筛选与肺腺癌细胞中TP53通路相关的基因(MDM2、ATM、TP53)，并构建评分Score，通过ROC分析得到肺腺癌中Score相应的截断值，可用于肺腺癌细胞中TP53通路相关基因是否突变的预测。本发明通过利用基因组合物表达量来预测肺腺癌特定基因突变，经验证发现该预测方法具有特异性好、准确性高的优点，有很好的应用前景。

公开(公告)号：CN113584176B

公开(公告)日：2023-06-30

申请号：CN202111031784.0

申请日：2021-09-03

Applicant: 复旦大学附属中山医院

Inventor： 曾德军 ,  单光耀 ,  卞赟艺 ,  胡正阳 ,  易彦均 ,  云丽娅 ,  詹成 ,  林宗武

IPC: C12Q1/6886 ,  G16B20/50 ,  G16B40/00

Abstract: 本发明公开了一种用于检测肺腺癌细胞中TP53通路相关基因突变的基因组合物以及预测模型和方法。本发明通过运用RNA测序、Lasso回归和二分类Logistic回归筛选与肺腺癌细胞中TP53通路相关的基因(MDM2、ATM、TP53)，并构建评分Score，通过ROC分析得到肺腺癌中Score相应的截断值，可用于肺腺癌细胞中TP53通路相关基因是否突变的预测。本发明通过利用基因组合物表达量来预测肺腺癌特定基因突变，经验证发现该预测方法具有特异性好、准确性高的优点，有很好的应用前景。

公开(公告)号：CN113637748A

公开(公告)日：2021-11-12

申请号：CN202110731156.7

申请日：2021-06-29

Applicant: 复旦大学附属中山医院

Inventor： 隋启海 ,  毕国澍 ,  胡正阳 ,  曾德军 ,  赵梦男 ,  王琳 ,  詹成 ,  林宗武

IPC: C12Q1/6886 ,  G16B40/20

Abstract: 本发明提供了一种用于预测肿瘤患者顺铂敏感性的试剂盒，该试剂盒包含：miRcute miRNA提取分离试剂盒、TruSeq miRNA Sample Prep Kitv2试剂盒和TruSeq SR Cluster Kitv3‑cBot–HS试剂盒。本发明提供的用于预测肿瘤患者顺铂敏感性的试剂盒，在数十例人肺腺癌组织和正常对照组织中进行验证，确定miR‑215‑5p，miR‑1283，miR‑129‑1‑3p，miR‑126‑3p，miR‑199b‑5p较目前其他预测顺铂敏感性的参数有着更高的稳定性和应用价值。