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公开(公告)号：CN108148811B
公开(公告)日：2022-03-01
申请号：CN201810037669.6
申请日：2018-01-16
Applicant: 复旦大学附属中山医院
Inventor： 许剑民 , 何国栋 , 鉴谧 , 常文举 , 任黎 , 韦烨 , 钟芸诗 , 牛正川 , 冯青阳 , 朱德祥 , 黄文柏 , 刘天宇 , 杨亮亮 , 陈竟文 , 易拓 , 吉美玲 , 彭上晋 , 林奇
IPC: C12N5/09 , A01K67/027
Abstract: 本发明涉及一种基于温敏型生物凝胶三维培养体系，所述的三维培养体系通过如下试剂组合制成：温敏型生物凝胶、分离和培养肿瘤细胞需要的消化液、基础培养基、人肠道干细胞培养基。本发明还提供一种基于温敏型生物凝胶三维培养体系建立结直肠癌患者来源的异种移植瘤模型的方法。其优点表现在：结直肠癌细胞在本发明的温敏型生物凝胶体三维培养体系中，可以进行进一步扩增生长，并增强其在免疫缺陷鼠中的成瘤能力。该体系培养出的多克隆肿瘤细胞，在裸鼠中具有良好的皮下成瘤能力。本发明制备方法简单，工艺成熟，可大幅度降低人源性结直肠癌异种移植瘤模型的构建的工时成本。
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公开(公告)号：CN112037852B
公开(公告)日：2024-09-27
申请号：CN202010904940.9
申请日：2020-09-01
Applicant: 复旦大学附属中山医院
Abstract: 本发明提供一种预测T1期结直肠癌淋巴结转移的方法和系统，以石蜡包埋组织切片为样本，利用液相色谱串联质谱，获取T1期结直肠癌淋巴结转移患者的蛋白质表型并建立基于蛋白质组学的诊断淋巴结转移模型，本发明相对于传统预测方式具有预测准确性高，有效减少非必要补救手术的优势。能针对每一病理给出一个淋巴结转移概率，更有利于精准治疗。
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公开(公告)号：CN115063435A
公开(公告)日：2022-09-16
申请号：CN202210579200.1
申请日：2022-05-26
Applicant: 复旦大学附属中山医院
Abstract: 本发明涉及一种基于多尺度类间的肿瘤及周围器官的分割方法，MRI图像送入预处理，对图像进行强度归一化以及直方图均衡化，把整个图像分成数量的小块像素进行非线性拉伸，使局部的灰度直方图均匀分布；将预处理过后的图像作为输入图像缩放输入至定位网络，定位出目标区域，然后在输入图像中裁剪出以目标为中心的图像，增大前景像素的占比，之后将所裁剪出的目标区域输入分割网络模型中进一步分割获得完整分割结果。本发明方法可以更好地定位感兴趣区域；有效地融合局部上下文和全局上下文信息；损失函数中融入了类间关系，更好地利用推理时标签的概率向量；提升了体素占比较少的肿瘤类别的精度。
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公开(公告)号：CN110257518B
公开(公告)日：2022-08-02
申请号：CN201910583680.7
申请日：2019-07-01
Applicant: 复旦大学附属中山医院
IPC: C12Q1/6886 , G16B20/20
Abstract: 本发明公开了一种用于预测转移性结直肠癌转化治疗疗效的基因集，其包括人类基因组中的下述10个基因位点：C18orf42、OR10V1、ATOH1、AC140061.12、TMEM26、KRTAP4‑2、PDK4、SPAG11B、SEC31B、LILRA5，这些基因位点的5hmC表观修饰水平预示转化治疗疗效，采用该基因集建立的数学模型可用于预测肝转移灶不可切除的转移性结直肠癌转化治疗疗效，帮助医生确定转化治疗方案，实施精准医疗。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN110257518A
公开(公告)日：2019-09-20
申请号：CN201910583680.7
申请日：2019-07-01
Applicant: 复旦大学附属中山医院
IPC: C12Q1/6886 , G16B20/20
Abstract: 本发明公开了一种用于预测转移性结直肠癌转化治疗疗效的基因集，其包括人类基因组中的下述10个基因位点：C18orf42、OR10V1、ATOH1、AC140061.12、TMEM26、KRTAP4-2、PDK4、SPAG11B、SEC31B、LILRA5，这些基因位点的5hmC表观修饰水平预示转化治疗疗效，采用该基因集建立的数学模型可用于预测肝转移灶不可切除的转移性结直肠癌转化治疗疗效，帮助医生确定转化治疗方案，实施精准医疗。
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公开(公告)号：CN109504778A
公开(公告)日：2019-03-22
申请号：CN201910026672.2
申请日：2019-01-11
Applicant: 复旦大学附属中山医院
IPC: C12Q1/6886 , G16H50/20
Abstract: 本发明涉及临床分子诊断技术领域，具体公开一种基于表观修饰的5hmC多分子标志物及结直肠癌早期诊断模型。本发明通过5-hmC高通量测序技术，对结直肠癌患者与健康人外周血浆DNA全基因组5-hmC表达量的检查，对比两组样本中全基因组基因位点5-hmC表达差异，筛选表达差异最显著的部分基因位点作为该诊断模型的基因标志物，进而构建结直肠癌的早期诊断模型。经验证，本发明诊断的灵敏度、特异度均较高，与目前市场上的粪便隐血检测试剂盒、spetin9试剂盒相比，灵敏度和特异度分别提高约20％、8％。本发明的诊断方法具有检测无创、便捷等优点，可应用于临床一线，用于结直肠癌的早期筛查。
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公开(公告)号：CN109504778B
公开(公告)日：2021-11-09
申请号：CN201910026672.2
申请日：2019-01-11
Applicant: 复旦大学附属中山医院
IPC: C12Q1/6886 , G16H50/20
Abstract: 本发明涉及临床分子诊断技术领域，具体公开一种基于表观修饰的5hmC多分子标志物及结直肠癌早期诊断模型。本发明通过5‑hmC高通量测序技术，对结直肠癌患者与健康人外周血浆DNA全基因组5‑hmC表达量的检查，对比两组样本中全基因组基因位点5‑hmC表达差异，筛选表达差异最显著的部分基因位点作为该诊断模型的基因标志物，进而构建结直肠癌的早期诊断模型。经验证，本发明诊断的灵敏度、特异度均较高，与目前市场上的粪便隐血检测试剂盒、spetin9试剂盒相比，灵敏度和特异度分别提高约20％、8％。本发明的诊断方法具有检测无创、便捷等优点，可应用于临床一线，用于结直肠癌的早期筛查。
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公开(公告)号：CN112037852A
公开(公告)日：2020-12-04
申请号：CN202010904940.9
申请日：2020-09-01
Applicant: 复旦大学附属中山医院
Abstract: 本发明提供一种预测T1期结直肠癌淋巴结转移的方法和系统，以石蜡包埋组织切片为样本，利用液相色谱串联质谱，获取T1期结直肠癌淋巴结转移患者的蛋白质表型并建立基于蛋白质组学的诊断淋巴结转移模型，本发明相对于传统预测方式具有预测准确性高，有效减少非必要补救手术的优势。能针对每一病理给出一个淋巴结转移概率，更有利于精准治疗。
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公开(公告)号：CN108148811A
公开(公告)日：2018-06-12
申请号：CN201810037669.6
申请日：2018-01-16
Applicant: 复旦大学附属中山医院
Inventor： 许剑民 , 何国栋 , 鉴谧 , 常文举 , 任黎 , 韦烨 , 钟芸诗 , 牛正川 , 冯青阳 , 朱德祥 , 黄文柏 , 刘天宇 , 杨亮亮 , 陈竟文 , 易拓 , 吉美玲 , 彭上晋 , 林奇
IPC: C12N5/09 , A01K67/027
Abstract: 本发明涉及一种基于温敏型生物凝胶三维培养体系，所述的三维培养体系通过如下试剂组合制成：温敏型生物凝胶、分离和培养肿瘤细胞需要的消化液、基础培养基、人肠道干细胞培养基。本发明还提供一种基于温敏型生物凝胶三维培养体系建立结直肠癌患者来源的异种移植瘤模型的方法。其优点表现在：结直肠癌细胞在本发明的温敏型生物凝胶体三维培养体系中，可以进行进一步扩增生长，并增强其在免疫缺陷鼠中的成瘤能力。该体系培养出的多克隆肿瘤细胞，在裸鼠中具有良好的皮下成瘤能力。本发明制备方法简单，工艺成熟，可大幅度降低人源性结直肠癌异种移植瘤模型的构建的工时成本。
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