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公开(公告)号:CN114242163B
公开(公告)日:2024-01-30
申请号:CN202010939999.1
申请日:2020-09-09
Applicant: 复旦大学
Abstract: 本发明公开了一种蛋白质组学的质谱数据的处理系统,包括客户端、服务端和NAS;服务端包括数据上传模块、数据管理模块、数据计算模块、数据库和若干服务器;数据上传模块用于接收用户经对应的客户端上传的质谱数据文件,并将质谱数据文件传输至数据管理模块;数据管理模块用于将质谱数据文件存储至NAS;数据计算模块用于根据实验的计算参数信息提交质谱数据计算任务,将质谱数据计算任务发布到不同优先等级的消息队列中,抓取消息队列中的任务信息,将质谱数据计算任务分配到若干服务器上执行;质谱数据计算任务用于将质谱数据文件经计算得到对应的蛋白质组表达数据。本发明能够一(56)对比文件Brenden Judson 等.Cloud IaaS for MassSpectrometry and Proteomics: On-DemandCoupling of Cloud Computing toExperimental Facilities《.ScienceCloud '17: Proceedings of the 8th Workshop onScientific Cloud Computing》.2017,17–24.张琳 等.基于MongoDB的蛋白质组学大数据存储系统设计《.计算机应用》.2016,(第S1期),232-236.刘海军 等.基于Make2D-DB Ⅱ构建水稻二维电泳-质谱联动数据库《.生物信息学》.2013,(第02期),105-108.孙瑞祥 等.基于质谱技术的计算蛋白质组学研究《.中国科学E辑:信息科学》.2006,(第2006(02)期),222-234.
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公开(公告)号:CN113555093A
公开(公告)日:2021-10-26
申请号:CN202010325028.8
申请日:2020-04-23
Applicant: 复旦大学
Abstract: 本发明公开了一种生物学样本检测信息的跟踪方法、系统、介质及电子设备,所述跟踪方法包括如下步骤:接收用户输入的标识信息;检测所述标识信息与预设参考信息是否一致;若一致,则确认所述用户通过身份验证;利用已通过身份验证的所述用户的标识信息关联样本检测信息,所述样本检测信息包括检测试剂的库存信息、样本提取过程信息、物流传递信息、样本制备过程信息、质谱检测信息及样本分析结果中的至少一种;存储所述样本检测信息;接收所述用户输入的查询指令;根据所述查询指令实时向所述用户反馈当前样本检测信息。本发明可以实现对样本各个检测环节的有效追踪,提高了用户体验。
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公开(公告)号:CN113674797B
公开(公告)日:2024-05-14
申请号:CN202010414708.7
申请日:2020-05-15
Applicant: 复旦大学
Abstract: 本发明公开了一种基于蛋白质组的数据检测系统、方法、设备及存储介质,所述数据检测系统包括:接收模块及执行模块;所述接收模块用于接收待检测信息,所述待检测信息包括蛋白质组信息;所述执行模块用于将所述待检测信息输入至检测模型以获取检测结果。本发明通过对机体功能的执行者蛋白质的检测,可以克服现有技术中全基因组测序、外显子测序或对基因表达产物mRNA检测而对机体所患疾病预测有偏差的缺陷,通过将蛋白质组信息输入至检测模型可以自动获取对用户的检测结果,从而避免了人工检测程序的繁琐性及高时长性,能够准确反映待检测用户的生理机能状态。
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公开(公告)号:CN113674798B
公开(公告)日:2024-04-26
申请号:CN202010415362.2
申请日:2020-05-15
Applicant: 复旦大学
Abstract: 本发明公开了一种蛋白质组学数据的分析方法及系统,分析方法包括:获取项目中每个实验对应的元数据以及蛋白质组学数据;根据元数据对实验进行分类处理;在网页端构建目标分析任务;通过网页端将目标分析任务发送至服务器端,并根据目标分析任务对应的目标分析工具以及目标分析工具的执行顺序对目标分析任务进行分析处理以获取分析结果;通过服务器端将分析结果发送至网页端。本发明中构建了一站式、可定制、流程化的蛋白质组学数据的分析系统,在基于网页端和服务器端实现云服务的同时,使得涵盖分析任务的整个分析流程,实现对蛋白质组学数据的自动化分析的同时,也提高了分析效率,提升了数据分析的通用性,满足了更高的用户分析需求。
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公开(公告)号:CN114242163A
公开(公告)日:2022-03-25
申请号:CN202010939999.1
申请日:2020-09-09
Applicant: 复旦大学
Abstract: 本发明公开了一种蛋白质组学的质谱数据的处理系统,包括客户端、服务端和NAS;服务端包括数据上传模块、数据管理模块、数据计算模块、数据库和若干服务器;数据上传模块用于接收用户经对应的客户端上传的质谱数据文件,并将质谱数据文件传输至数据管理模块;数据管理模块用于将质谱数据文件存储至NAS;数据计算模块用于根据实验的计算参数信息提交质谱数据计算任务,将质谱数据计算任务发布到不同优先等级的消息队列中,抓取消息队列中的任务信息,将质谱数据计算任务分配到若干服务器上执行;质谱数据计算任务用于将质谱数据文件经计算得到对应的蛋白质组表达数据。本发明能够一站式解决质谱数据的管理、存储和计算,用户使用方便,操作简单。
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公开(公告)号:CN113674798A
公开(公告)日:2021-11-19
申请号:CN202010415362.2
申请日:2020-05-15
Applicant: 复旦大学
Abstract: 本发明公开了一种蛋白质组学数据的分析方法及系统,分析方法包括:获取项目中每个实验对应的元数据以及蛋白质组学数据;根据元数据对实验进行分类处理;在网页端构建目标分析任务;通过网页端将目标分析任务发送至服务器端,并根据目标分析任务对应的目标分析工具以及目标分析工具的执行顺序对目标分析任务进行分析处理以获取分析结果;通过服务器端将分析结果发送至网页端。本发明中构建了一站式、可定制、流程化的蛋白质组学数据的分析系统,在基于网页端和服务器端实现云服务的同时,使得涵盖分析任务的整个分析流程,实现对蛋白质组学数据的自动化分析的同时,也提高了分析效率,提升了数据分析的通用性,满足了更高的用户分析需求。
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公开(公告)号:CN113674797A
公开(公告)日:2021-11-19
申请号:CN202010414708.7
申请日:2020-05-15
Applicant: 复旦大学
Abstract: 本发明公开了一种基于蛋白质组的数据检测系统、方法、设备及存储介质,所述数据检测系统包括:接收模块及执行模块;所述接收模块用于接收待检测信息,所述待检测信息包括蛋白质组信息;所述执行模块用于将所述待检测信息输入至检测模型以获取检测结果。本发明通过对机体功能的执行者蛋白质的检测,可以克服现有技术中全基因组测序、外显子测序或对基因表达产物mRNA检测而对机体所患疾病预测有偏差的缺陷,通过将蛋白质组信息输入至检测模型可以自动获取对用户的检测结果,从而避免了人工检测程序的繁琐性及高时长性,能够准确反映待检测用户的生理机能状态。
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公开(公告)号:CN119185054A
公开(公告)日:2024-12-27
申请号:CN202411385900.2
申请日:2024-09-30
Applicant: 复旦大学附属金山医院(上海市金山区眼病防治所、上海市金山区核化伤害应急救治中心)
Abstract: 本发明公开了一种足部氧疗仓装置及其使用方法,所述足部氧疗仓装置包括:仓体,仓体内具有一空腔,仓体的一端开设一孔洞,孔洞与空腔连通设置;弹力套,弹力套的一端围绕于孔洞设置,弹力套的另一端设有环形绷带;把手,把手固定设置于仓体的上表面;透气组件,透气组件设置于空腔内,透气组件与空腔的底部之间形成一间隙;进气口,进气口设置于仓体一侧的底部,进气口与间隙连通设置;消毒灯,消毒灯设置于空腔的顶部。通过对本发明的应用,为患者的足部提供了专门的氧疗环境,满足特殊护理或康复的需求,装置内的透气弹力布受压下沉可包覆足部,为患者提供舒适支撑和贴合感。
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公开(公告)号:CN113555095A
公开(公告)日:2021-10-26
申请号:CN202010343096.7
申请日:2020-04-23
Applicant: 复旦大学
Abstract: 本发明公开了一种基于物联网的数据管理方法、系统、介质及电子设备,所述数据管理方法包括如下步骤:接收第一用户输入的注册信息;根据所述注册信息生成与所述第一用户对应的识别标识;利用所述识别标识标注与所述第一用户关联的样本检测信息,所述样本检测信息包括样本提取过程信息、物流传递信息、样本制备过程信息、质谱检测信息及样本分析结果;存储所述样本检测信息;接收第一用户输入的第一查询指令;根据所述第一查询指令向所述第一用户实时反馈所述样本检测信息。本发明可以实现各个检测环节的有效追踪,提高了用户体验。
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