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公开(公告)号：CN115602246A
公开(公告)日：2023-01-13
申请号：CN202211366121.9
申请日：2022-10-31
Applicant: 哈尔滨工业大学(CN)
Abstract: 一种基于群体基因组的序列比对方法，具体涉及一种基于群体基因组的人体DNA序列比对方法，为了解决以单一参考基因组作为基准的序列比对方法存在精度偏差，导致测序数据变异检测失败或得到错误变异位点的问题，首先构建基于种子序列的群体基因组索引，提取测序序列的种子序列，利用索引获取种子序列在基因组的位置；其次，根据位置利用稀疏动态规划方法得到种子序列在基因组上最优和次优路径集合；最终，根据最优和次优路径集合得到测序序列在基因组上对应的序列，采用KSW2算法比对测序序列与对应的序列，得到比对得分，根据比对得分得到结果比对文件。属于序列比对领域。
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