公开(公告)号：CN118248206A

公开(公告)日：2024-06-25

申请号：CN202410222705.1

申请日：2024-02-28

Applicant: 哈尔滨工业大学(深圳)(哈尔滨工业大学深圳科技创新研究院)

Inventor： 李君一 ,  周雨桓 ,  吴宇琳 ,  袁维蔚 ,  王轩

IPC: G16B5/00 ,  G16B40/00 ,  G06F18/22 ,  G16H70/40 ,  G16C20/30 ,  G16C20/70

Abstract: 本发明公开了一种基于异构网络的药物靶标关联预测方法及装置，方法包括：获取药物之间的相似性矩阵和靶点之间的相似性矩阵，通过结合药物靶点关联二部图网络构建异构网络；通过图注意网络层提取不同层的节点嵌入，并提取各节点嵌入对应的核矩阵；基于多核融合策略获得最终药物嵌入向量和最终靶点嵌入向量，并将所述最终药物嵌入向量和所述最终靶点嵌入向量输入双拉普拉斯正则化最小二乘法模型，预测及输出药物和靶点之间的关联结果。本发明在药物靶标关联预测领域，结合了图注意力网络、多核学习方法、双拉普拉斯正则化最小二乘法框架构建链路预测模型，有效补充了节点信息丰富度，提高预测性能。

公开(公告)号：CN116246699B

公开(公告)日：2024-04-26

申请号：CN202211105940.8

申请日：2022-09-07

Applicant: 哈尔滨工业大学(深圳)(哈尔滨工业大学深圳科技创新研究院)

Inventor： 李君一 ,  朱焱 ,  周雨桓 ,  王轩 ,  刘洋 ,  漆舒汉 ,  吴宇琳 ,  姚霖 ,  刘博 ,  王亚东

IPC: G16B20/00 ,  G16B40/00 ,  G06F16/36 ,  G06N3/0464

Abstract: 本发明公开了一种基于知识图谱的合成致死预测方法、设备及存储介质，该方法包括：基于知识图谱卷积网络获得第一基因特征；根据合成致死相互作用网络获得第二基因特征；计算所述第一基因特征和所述第二基因特征的向量内积，预测基因对的合成致死概率。由此解决了当前需要人工设计基因特征，以及无法通过建模合成致死相互作用背后机制的问题，在提升基因对的合成致死预测性能的同时，还提高了模型的可解释性。

公开(公告)号：CN116246699A

公开(公告)日：2023-06-09

申请号：CN202211105940.8

申请日：2022-09-07

Applicant: 哈尔滨工业大学(深圳)(哈尔滨工业大学深圳科技创新研究院)

Inventor： 李君一 ,  朱焱 ,  周雨桓 ,  王轩 ,  刘洋 ,  漆舒汉 ,  吴宇琳 ,  姚霖 ,  刘博 ,  王亚东

IPC: G16B20/00 ,  G16B40/00 ,  G06F16/36 ,  G06N3/0464

Abstract: 本发明公开了一种基于知识图谱的合成致死预测方法、设备及存储介质，该方法包括：基于知识图谱卷积网络获得第一基因特征；根据合成致死相互作用网络获得第二基因特征；计算所述第一基因特征和所述第二基因特征的向量内积，预测基因对的合成致死概率。由此解决了当前需要人工设计基因特征，以及无法通过建模合成致死相互作用背后机制的问题，在提升基因对的合成致死预测性能的同时，还提高了模型的可解释性。