公开(公告)号：CN105861666A

公开(公告)日：2016-08-17

申请号：CN201610242689.8

申请日：2016-04-19

Applicant: 哈尔滨工业大学(威海)

Inventor： 高志磊 ,  王晋 ,  张会敏 ,  吕志伟 ,  王伟民 ,  张治洲

IPC: C12Q1/68 ,  C12N15/11

CPC classification number: C12Q1/689 ,  C12Q2600/156

Abstract: 本发明涉及生物技术领域中的菌群检测方法，尤其是一种测定菌群组成结构的引物设计方法及测定菌群组成结构的方法，引物设计是基于各个纲的核糖体基因的总拷贝数的定量方法，而非各个纲包括的各个物种细胞的详细个数。测定菌群组成结构的方法主要包括纲特异性引物的设计过程；qPCR体系的配置；qPCR条件的设定与运行等步骤。基于纲特异性引物的定量扩增技术可以在纲的层面上快速考察样本中菌群的若干宏观结构及其在不同样本中的差异。

公开(公告)号：CN106222249A

公开(公告)日：2016-12-14

申请号：CN201610552455.3

申请日：2016-07-14

Applicant: 哈尔滨工业大学(威海)

Inventor： 张会敏 ,  李凯强 ,  苏立宇 ,  何鸿魁 ,  余秀娟 ,  曹润杰 ,  汤知辉 ,  王伟民 ,  张治洲

IPC: C12Q1/68 ,  C12Q1/04 ,  C12N15/11

CPC classification number: C12Q1/689 ,  C12Q1/6851 ,  C12Q1/6895 ,  C12Q2531/113 ,  C12Q2545/113 ,  C12Q2563/107

Abstract: 本发明涉及一种测定微生物群落中已知基因组信息物种的种特异性引物的设计方法及测定菌种含量的方法，属于生物技术领域。本发明是一种基于微生物群落中某些已知基因组信息的物种的种特异性引物的设计方法，该设计方法包括近全长的核糖体基因文库克隆测序；生物信息学分析(BLAST等)确定菌群中的物种及其相对丰度；查询已经具备基因组序列的物种；依据PRIMER-BLAST工具设计物种特异性引物；引物特异性检测。菌种含量测定是通过QPCR方法使用本发明的物种特异性引物，定量测定相应物种在微生物群落中的含量。这种测定微生物群落中已知微生物含量的方法可以在种的层次上跟踪考察某些重要微生物物种在重要生物学过程如白酒发酵过程中的数量变化。本发明是针对某些微生物基因组中物种特异性的非核糖体基因序列的