一种面向长读长RNA-seq测序数据的融合基因检测方法

    公开(公告)号:CN119763662A

    公开(公告)日:2025-04-04

    申请号:CN202411842245.9

    申请日:2024-12-13

    Abstract: 一种面向长读长RNA‑seq测序数据的融合基因检测方法,本发明涉及面向长读长RNA‑seq测序数据的融合基因检测方法。本发明的目的是为了解决现有方法在多种人类癌症测序数据上识别融合基因过程计算资源占用过高,识别结果的准确性较低等问题。过程为:一:生成仅含转录本序列的重组参考转录本以及重组转录本注释;二:得到过滤后的测序片段;三:寻找融合基因对;四:得到断点还原后的每个融合基因对;对断点还原后的每个融合基因对的测序片段按照断点位置进行层次聚类,每个聚类簇为融合基因对;五:得到RNA‑seq比对结果;六:根据RNA‑seq比对结果,对四得到的融合基因对进行筛选,获得最终的融合基因对。本发明用于融合基因筛选领域。

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