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公开(公告)号：CN118471334A
公开(公告)日：2024-08-09
申请号：CN202410670841.7
申请日：2024-05-28
Applicant: 哈尔滨工业大学
Abstract: 基于非线性距离和马尔可夫流形算法的基因表达量预测方法，它属于生物信息学技术领域。本发明解决了传统基因表达量预测方法存在预测准确率低的问题。本发明利用不同批次的单细胞RNA测序数据构造基因表达量矩阵，再对基因表达量矩阵进行移除批次效应和标准化处理，得到处理后的矩阵；再根据处理后的矩阵构建邻接图，基于邻接图计算非线性距离矩阵，根据非线性距离矩阵计算马尔可夫概率转移矩阵；并根据马尔可夫概率转移矩阵进行流形扩散预测，得到流形扩散预测的基因表达矩阵，最后基于流形扩散预测的基因表达矩阵计算基因表达量预测结果。本发明方法可以应用于基因表达量预测。
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