公开(公告)号：CN112562785A

公开(公告)日：2021-03-26

申请号：CN202011452042.0

申请日：2020-12-10

Applicant: 哈尔滨医科大学附属第一医院 ,  中国人民解放军军事科学院军事医学研究院

Inventor： 卢美松 ,  陈河兵 ,  汤小晗 ,  王军婷 ,  李昊 ,  陶欢 ,  伯晓晨

IPC: G16B20/20 ,  G16B20/30 ,  G16B30/20 ,  G16B35/20 ,  G16B50/00

Abstract: 本发明涉及基因筛选技术领域，涉及基于ATAC测序数据筛选子宫内膜癌关键基因的方法及应用。本发明提供的基于ATAC测序数据的肿瘤关键基因的筛选方法包括，首先选取两个以上的指标将ATAC测序所得的峰位进行排序；然后将不同指标的峰位排序结果按照峰位数量均分成组，选择至少一组作为疑似包含肿瘤关键基因的初筛峰位分组；再筛选出初筛峰位分组中共同含有的峰位构成次筛峰位分组；最后根据目的肿瘤的基因表达值，对得到的次筛峰位分组中各峰位对应的基因进行最终筛选，得到肿瘤关键基因。该方法基于ATAC测序数据，通过选取多个判断指标对目的肿瘤的关键基因进行筛选，可以避免数据处理过程中人为因素的干扰，具有更高的可靠性。

公开(公告)号：CN112562785B

公开(公告)日：2024-06-14

申请号：CN202011452042.0

申请日：2020-12-10

Applicant: 哈尔滨医科大学附属第一医院 ,  中国人民解放军军事科学院军事医学研究院

Inventor： 卢美松 ,  汤小晗 ,  陈河兵 ,  王军婷 ,  李昊 ,  陶欢 ,  伯晓晨

IPC: G16B20/20 ,  G16B20/30 ,  G16B30/20 ,  G16B35/20 ,  G16B50/00

Abstract: 本发明涉及基因筛选技术领域，涉及基于ATAC测序数据筛选子宫内膜癌关键基因的方法及应用。本发明提供的基于ATAC测序数据的肿瘤关键基因的筛选方法包括，首先选取两个以上的指标将ATAC测序所得的峰位进行排序；然后将不同指标的峰位排序结果按照峰位数量均分成组，选择至少一组作为疑似包含肿瘤关键基因的初筛峰位分组；再筛选出初筛峰位分组中共同含有的峰位构成次筛峰位分组；最后根据目的肿瘤的基因表达值，对得到的次筛峰位分组中各峰位对应的基因进行最终筛选，得到肿瘤关键基因。该方法基于ATAC测序数据，通过选取多个判断指标对目的肿瘤的关键基因进行筛选，可以避免数据处理过程中人为因素的干扰，具有更高的可靠性。