一种基于荧光光谱的基因检测数据处理方法

    公开(公告)号:CN117316277A

    公开(公告)日:2023-12-29

    申请号:CN202311606284.4

    申请日:2023-11-29

    Applicant: 吉林大学

    Abstract: 本发明涉及数字数据处理技术领域,具体涉及一种基于荧光光谱的基因检测数据处理方法,结合各数字化数据构建结构化矩阵;计算样本的基因光谱特异性指数;构建荧光强度指数;结合实验过程中各样本的实验时间构建时间系数;根据结构化矩阵中所有样本的实验存放条件值与标准存放条件值之间的差异构建实验环境指数;根据荧光强度指数、时间系数以及实验环境指数计算实验条件影响因子;结合各样本的基因光谱特异性指数及实验条件影响因子构建各样本的孤立森林改进参数,获取异常样本,结合XGBoost算法预测各异常样本的基因突变概率,检测基因突变样本,完成基因检测数据的处理。从而实现基因突变样本的检测,具有较高异常检测精度。

    一种基于荧光光谱的基因检测数据处理方法

    公开(公告)号:CN117316277B

    公开(公告)日:2024-02-06

    申请号:CN202311606284.4

    申请日:2023-11-29

    Applicant: 吉林大学

    Abstract: 本发明涉及数字数据处理技术领域,具体涉及一种基于荧光光谱的基因检测数据处理方法,结合各数字化数据构建结构化矩阵;计算样本的基因光谱特异性指数;构建荧光强度指数;结合实验过程中各样本的实验时间构建时间系数;根据结构化矩阵中所有样本的实验存放条件值与标准存放条件值之间的差异构建实验环境指数;根据荧光强度指数、时间系数以及实验环境指数计算实验条件影响因子;结合各样本的基因光谱特异性指数及实验条件影响因子构建各样本的孤立森林改进参数,获取异常样本,结合XGBoost算法预测各异常样本的基因突变概率,检测基因突变样本,完成基因检测数据的处理。从而实现基因突变样本的检测,具有较高异常检测精度。(56)对比文件Jian Zhao etal.“Time-ResolvedActivation of pH Sensing and Imaging inVivo by a Remotely Controllable DNANanomachine”《.Nano Letters》.2019,第874-880页.

    基于图像处理的高通量基因测序数据处理方法

    公开(公告)号:CN117392155A

    公开(公告)日:2024-01-12

    申请号:CN202311685051.8

    申请日:2023-12-11

    Applicant: 吉林大学

    Abstract: 本发明涉及图像处理技术领域,具体涉及基于图像处理的高通量基因测序数据处理方法,包括:采集高通量基因灰度图像;根据高通量基因灰度图像得到延伸像素点;根据延伸像素点得到邻域方向差异程度;根据邻域方向差异程度得到初始区域可能性;根据初始区域可能性得到区域可能性;根据高通量基因灰度图像得到碱基区域灰度分界值以及深色区域灰度区间;根据深色区域灰度区间以及碱基区域灰度分界值得到区间分界值;根据区间分界值对深色区域灰度区间进行修正得到修正灰度值;根据修正灰度值得到碱基区域。本发明使分割出的碱基区域更加完整,提高了分割结果的准确性,提高了获取基因序列信息的效率。

    基于图像处理的高通量基因测序数据处理方法

    公开(公告)号:CN117392155B

    公开(公告)日:2024-02-09

    申请号:CN202311685051.8

    申请日:2023-12-11

    Applicant: 吉林大学

    Abstract: 本发明涉及图像处理技术领域,具体涉及基于图像处理的高通量基因测序数据处理方法,包括:采集高通量基因灰度图像;根据高通量基因灰度图像得到延伸像素点;根据延伸像素点得到邻域方向差异程度;根据邻域方向差异程度得到初始区域可能性;根据初始区域可能性得到区域可能性;根据高通量基因灰度图像得到碱基区域灰度分界值以及深色区域灰度区间;根据深色区域灰度区间以及碱基区域灰度分界值得到区间分界值;根据区间分界值对深色区域灰度区间进行修正得到修正灰度值;根据修正灰度值得到碱基区域。本发明使分割出的碱基区域更加完整,提高了分割结果的准确性,提高了获取基因序列信息的效率。

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