一个核酸适配子筛选文库

    公开(公告)号:CN102732972A

    公开(公告)日:2012-10-17

    申请号:CN201210045270.5

    申请日:2012-02-27

    Applicant: 南昌大学

    Abstract: 一个核酸适配子筛选文库,属生物分析与生物工程技术领域。具有以下特定的核苷酸序列:文库为5′-ACCGACCGTGCTGGACTCT(N40)ACTATGAGCGAGCCTGGCG-3′;上游引物为5′-ACCGACCGTGCTGGACTCT-3′;下游引物为5′-CGCCAGGCTCGCTCATAGT-3′。本文库具有接近长度下限的短固定序列和较长的随机序列,充分保证了文库中单链寡核苷酸的多样性;文库固定序列(引物序列)的独特设计能使用高退火温度进行PCR扩增,既能有效抑制非特异性产物,又不影响扩增目的产物,在对称PCR扩增、不对称PCR扩增和实时荧光定量PCR扩增中均得到证实。本发明设计出的随机单链寡核苷酸文库,性能优秀,为成功筛选生物靶标的核酸适配子提供了保证。

    基于核酸适配子的肝癌诊断试剂盒

    公开(公告)号:CN102732606A

    公开(公告)日:2012-10-17

    申请号:CN201210045269.2

    申请日:2012-02-27

    Applicant: 南昌大学

    Abstract: 一种基于核酸适配子的肝癌诊断试剂盒,由下列独立包装的组分组成:肝癌核酸适配子溶液;聚丙烯酰胺凝胶母液;过硫酸铵;四甲基二乙胺;50%甘油溶液I;50%甘油溶液II;1.25M氯化钠溶液;GelRed染料溶液;阳性对照血清;阴性对照血清。本发明的试剂盒具有如下特点:(1)诊断价值大,敏感度、特异度和准确度达到85%左右;(2)简便实用,只需常规的垂直电泳及凝胶图像分析系统即可完成;(3)成本低廉,附加值高。肝癌是临床常见的恶性肿瘤之一,将本试剂盒投入临床应用,不但用量大,而且能有效提高肝癌的诊断水平,产生良好的经济效益和社会效益,应用前景良好。

    一组肝癌血清核酸适配子

    公开(公告)号:CN102732522A

    公开(公告)日:2012-10-17

    申请号:CN201210045271.X

    申请日:2012-02-27

    Applicant: 南昌大学

    Abstract: 一组肝癌血清核酸适配子,属生物医学检测分析技术领域。本发明公开了9个以肝癌血清为靶标筛选出的肝癌血清核酸适配子的核酸序列,通过聚丙烯酰胺凝胶电泳及灰度测定方法分析了它们与肝癌和非肝癌血清标本的结合程度,显示每个核酸适配子对肝癌均具有良好的诊断价值,受试者工作特征曲线下面积达0.894~0.949,鉴别肝癌与非肝癌患者的准确度达84.4%~91.4%。这些核酸适配子可直接或修饰后应用于肝癌血清标本的分析,为肝癌的临床诊断、治疗和预后判断提供实验依据,也可应用于建立基于核酸适配子的肝癌检测新技术,具有良好的应用价值。

    一种多步连环选择的血清核酸适配子体外筛选方法

    公开(公告)号:CN102732505A

    公开(公告)日:2012-10-17

    申请号:CN201210045414.7

    申请日:2012-02-27

    Applicant: 南昌大学

    Abstract: 一种多步连环选择的血清核酸适配子体外筛选方法,属生物医学检测分析技术领域,其特征是通过以混合血清为筛选靶标消除个体差异,先以正常血清反筛去除文库中能与非特异性血清成分结合的核酸序列,再以混合血清正筛继而克隆测序分离核酸适配子,通过对核酸适配子的结构模拟分析、特异性分析、亲和力分析和应用价值分析,优选出应用价值大的核酸适配子。本发明克服了血清中大量非特异性成分的干扰,可以直接以血清为靶标高通量筛选出血清中疾病特异性成分的核酸适配子,既高效又经济,可为建立基于核酸适配子的分析技术并系统性探索疾病的发生发展规律和获取临床诊疗相关的生物信息奠定基础,具有良好的应用价值。

    一种多步连环选择的血清核酸适配子体外筛选方法

    公开(公告)号:CN102732505B

    公开(公告)日:2014-07-16

    申请号:CN201210045414.7

    申请日:2012-02-27

    Applicant: 南昌大学

    Abstract: 一种多步连环选择的血清核酸适配子体外筛选方法,属生物医学检测分析技术领域,其特征是通过以混合血清为筛选靶标消除个体差异,先以正常血清反筛去除文库中能与非特异性血清成分结合的核酸序列,再以混合血清正筛继而克隆测序分离核酸适配子,通过对核酸适配子的结构模拟分析、特异性分析、亲和力分析和应用价值分析,优选出应用价值大的核酸适配子。本发明克服了血清中大量非特异性成分的干扰,可以直接以血清为靶标高通量筛选出血清中疾病特异性成分的核酸适配子,既高效又经济,可为建立基于核酸适配子的分析技术并系统性探索疾病的发生发展规律和获取临床诊疗相关的生物信息奠定基础,具有良好的应用价值。

    一组肝癌血清核酸适配子

    公开(公告)号:CN102732522B

    公开(公告)日:2014-04-09

    申请号:CN201210045271.X

    申请日:2012-02-27

    Applicant: 南昌大学

    Abstract: 一组肝癌血清核酸适配子,属生物医学检测分析技术领域。本发明公开了9个以肝癌血清为靶标筛选出的肝癌血清核酸适配子的核酸序列,通过聚丙烯酰胺凝胶电泳及灰度测定方法分析了它们与肝癌和非肝癌血清标本的结合程度,显示每个核酸适配子对肝癌均具有良好的诊断价值,受试者工作特征曲线下面积达0.894~0.949,鉴别肝癌与非肝癌患者的准确度达84.4%~91.4%。这些核酸适配子可直接或修饰后应用于肝癌血清标本的分析,为肝癌的临床诊断、治疗和预后判断提供实验依据,也可应用于建立基于核酸适配子的肝癌检测新技术,具有良好的应用价值。

    基于核酸适配子的肝癌诊断试剂盒

    公开(公告)号:CN102732606B

    公开(公告)日:2013-11-27

    申请号:CN201210045269.2

    申请日:2012-02-27

    Applicant: 南昌大学

    Abstract: 一种基于核酸适配子的肝癌诊断试剂盒,由下列独立包装的组分组成:肝癌核酸适配子溶液;聚丙烯酰胺凝胶母液;过硫酸铵;四甲基二乙胺;50%甘油溶液I;50%甘油溶液II;1.25M氯化钠溶液;GelRed染料溶液;阳性对照血清;阴性对照血清。本发明的试剂盒具有如下特点:(1)诊断价值大,敏感度、特异度和准确度达到85%左右;(2)简便实用,只需常规的垂直电泳及凝胶图像分析系统即可完成;(3)成本低廉,附加值高。肝癌是临床常见的恶性肿瘤之一,将本试剂盒投入临床应用,不但用量大,而且能有效提高肝癌的诊断水平,产生良好的经济效益和社会效益,应用前景良好。

    一种基于常规凝胶电泳的核酸适配子诊断应用方法

    公开(公告)号:CN102559917A

    公开(公告)日:2012-07-11

    申请号:CN201210045266.9

    申请日:2012-02-27

    Applicant: 南昌大学

    Abstract: 一种基于常规凝胶电泳的核酸适配子诊断应用方法,属生物医学检测分析技术领域。本发明将核酸适配子与血清标本孵育,然后进行常规聚丙烯酰胺凝胶电泳和核酸染色,紫外灯下观察结果并采集紫外滤光图像,通过凝胶图像分析软件测定游离核酸适配子带的灰度值,定量分析病例与对照之间的差异,从而实现定量诊断。本发明以肝癌血清核酸适配子应用于肝癌诊断为研究模型,敏感度、特异度和准确度均高达90%以上。本发明方法简便易,实用价值大,诊断效率高,应用前景良好。

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