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公开(公告)号:CN117198395A
公开(公告)日:2023-12-08
申请号:CN202310792627.4
申请日:2023-06-30
Applicant: 南开大学 , 农业农村部环境保护科研监测所
Abstract: 本发明涉及一种预测土壤根际微生物多样性的机器学习方法,包括如下步骤:收集文献中不同地点土壤的包含植物种类、根际微生物基因测序序列号、土壤理化性质等在内的数据,并填补环境特征、气候条件相关数据,建立土壤数据库;根据所获取的基因测序数据序列号,下载根际微生物测序数据,得到土壤根际微生物原始数据,选择能够反映土壤根际微生物多样性的合适指标,确定机器学习模型的输出;基于土壤数据库,使用机器学习特征筛选方法进行特征筛选,得到筛选后的特征集;基于机器学习算法对所筛选出的特征进行重要性分析并排序,获得显著性信息;基于机器学习算法将筛选后的特征集输入到机器学习模型进行训练,得到预测的根际土壤微生物多样性结果。