用于检测牛CWC15基因隐性致死突变的引物及试剂盒

    公开(公告)号:CN104131084A

    公开(公告)日:2014-11-05

    申请号:CN201410311877.2

    申请日:2014-07-02

    CPC classification number: C12Q1/6858 C12Q2531/113 C12Q2521/301 C12Q2565/125

    Abstract: 本发明提供用于检测牛CWC15基因隐性致死突变的特异性引物,包括:上游引物5’-GGGACTGAGGATGAAGTTGC-3’和下游引物5’-GGTTGGGAATACGGAAAGGT-3’。本发明还提供利用所述引物或含有所述引物的试剂盒检测牛CWC15基因隐性致死突变的方法。本发明首次建立了基于PCR-RFLP技术的CWC15基因隐性致死突变的分子检测方法。与已报道的基于SNP单倍型的检测方法(VanRaden等,2011)相比,具有操作简单、成本低、结果可靠等优点。另外,本发明在进行引物设计时,巧妙利用了致死突变位点下游715bp处的另外一个相同的酶切位点,所设计的PCR引物能扩增包含这两个酶切位点的片段,且酶切后的条带能够通过琼脂糖凝胶电泳直接区分,避免了因酶切不完全或酶切反应失败而导致的假阳性,从而确保检测的准确性。

    一种奶牛全基因组中高密度SNP芯片及其应用

    公开(公告)号:CN117431324A

    公开(公告)日:2024-01-23

    申请号:CN202311218327.1

    申请日:2023-09-20

    Abstract: 本发明提供一种中高密度奶牛全基因组126K SNP芯片,其包含检测120,155个SNP位点的试剂,所述SNP位点来自:第一类,发明人团队前期研究挖掘与鉴定的奶牛重要经济性状显著相关的SNP位点,包含5,363个SNP位点;第二类,奶牛主要遗传缺陷基因位点和亲子鉴定基因位点,包含223个SNP个位点;第三类,基于我国的大规模奶牛群体,根据检出率、基因频率、位置唯一性、基因型填充原理及基因组上的分布,从现有商业化奶牛基因组芯片挑选的SNP位点,包含114,569个SNP位点。本发明的芯片,可用于进行中国荷斯坦牛的全基因组关联分析、全基因组选择育种、亲子鉴定和常见牛遗传缺陷鉴定等方面。

    一种预测中国荷斯坦牛乳房炎发病风险的系统

    公开(公告)号:CN111506881B

    公开(公告)日:2022-11-04

    申请号:CN202010528636.9

    申请日:2020-06-11

    Abstract: 本发明公开了一种预测中国荷斯坦牛乳房炎发病风险的系统。本发明公开的预测中国荷斯坦牛乳房炎发病风险的系统包括参数采集物质和风险预测模块,所采集参数为待测奶牛的所处的场规模与季节、分娩胎次、泌乳阶段以及SCC或SCS,风险预测模块能用于预测乳房炎发病风险。实验证明,利用本发明的系统预测乳房炎发病风险准确性高,灵敏度高,特异性高,预测简单快速,可以实现提前发现具有高乳房炎发病风险的奶牛,进而在生产中提前防范,防止奶牛患乳房炎,对奶牛乳房炎发生的早期检测和预防具有重要的指导意义,适于推广应用。

    一种检测牛APAF1基因隐性致死突变的方法

    公开(公告)号:CN105838821B

    公开(公告)日:2019-12-06

    申请号:CN201610394658.4

    申请日:2016-06-06

    Abstract: 本发明提供了一种检测牛APAF1基因隐性致死突变的方法,涉及分子生物学领域,本发明方法基于焦磷酸测序技术,采用一对扩增引物、一条通用引物和一条测序引物,其核苷酸序列如SEQ ID No.1、2、3、4所示,对牛5号染色体63150400bp位点的单核苷酸多态性进行分析,结果发现牛APAF1基因野生型纯合子在C碱基处有峰,T碱基处无峰;而致死突变携带者在C碱基与T碱基处均有峰。本发明提供的方法操作简单,灵敏度高,准确性强,通量高,检测成本低,可快速检测APAF1基因隐性致死突变携带者的个体,在牛的育种过程中具有重要应用价值。

    一种检测牛SMC2基因隐性致死突变的方法

    公开(公告)号:CN106011250A

    公开(公告)日:2016-10-12

    申请号:CN201610393611.6

    申请日:2016-06-06

    Abstract: 本发明提供了一种检测牛SMC2基因隐性致死突变的方法,涉及分子生物学领域,本发明方法基于焦磷酸测序技术,采用一对引物、一条通用引物和一条测序引物,核苷酸序列如SEQ ID No.1、2、3、4所示,对牛8号染色体95410507bp位点的单核苷酸多态性进行分析,结果发现野生型纯合子在突变位点处为T/T基因型,焦磷酸测序结果图显示T碱基与C碱基的峰高比例为3:1;而致死突变携带者峰图在突变位点处为T/C基因型,焦磷酸测序结果图显示T碱基与C碱基的峰高比例为5:3。本发明提供的方法操作简单,灵敏度高,准确性强,通量高,检测成本低,在牛的保种、育种过程中具有重要应用价值。

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