一种基于耗散粒子动力学模拟的细胞骨架建模方法

    公开(公告)号:CN115641917A

    公开(公告)日:2023-01-24

    申请号:CN202211342192.5

    申请日:2022-10-31

    Applicant: 南开大学

    Abstract: 本发明提供了一种基于耗散粒子动力学模拟的细胞骨架建模方法,包括以下步骤:步骤1:在耗散粒子动力学模拟软件中设定细胞区域;步骤2:在细胞区域内随机分布、互不交叉的微丝单链;步骤3:在细胞区域内随机生成若干游离的所述交联蛋白粒子;步骤4:所述微丝单链与交联蛋白粒子进行聚合/解离,直至三种状态的交联蛋白粒子的数量均趋于稳态,交联蛋白粒子的三种状态分别为游离、只与一条微丝单链结合和与两条微丝单链结合;步骤5:删除交联蛋白粒子,并将同一交联蛋白粒子所连接的两个所述微丝单链直接相连;步骤6:计算细胞骨架参数,输出细胞骨架模型。本发明所构建的细胞骨架具有高保真度,在外力作用下呈现粘弹性等机械特性。

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