一种基于双协同线性流形的药物关联预测方法

    公开(公告)号:CN110993121A

    公开(公告)日:2020-04-10

    申请号:CN201911239229.X

    申请日:2019-12-06

    Applicant: 南开大学

    Abstract: 一种基于双协同线性流形的药物关联预测方法,该预测方法属于数据挖掘、生物信息领域,包括:1)根据药物间关联关系数据,构建药物-药物节点间初始目标关联矩阵;2)根据药物靶蛋白间关联关系数据和靶蛋白间关联关系数据,构建药物-靶蛋白和靶蛋白-靶蛋白节点间辅助关联矩阵;3)获取初始目标关联矩阵与辅助矩阵的流形作为输入,构建双协同线性流形学习模型;4)根据一致性原则,通过迭代更新,丰富目标矩阵信息,获取评分较高的关联,认为该两种药物之间存在关联关系,完成药物关联预测任务。本发明采用流形来测量数据的相关性,并采用协作学习来充分利用网络内的一致性。可有效地提高预测的准确性,适用于药物-药物关联预测。

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