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公开(公告)号:CN118655324A
公开(公告)日:2024-09-17
申请号:CN202311747460.6
申请日:2023-12-18
Applicant: 南京大学
IPC: G01N33/68 , G01N27/26 , G01N33/531 , G01N33/53 , C12Q1/6869
Abstract: 本申请提供了一种嵌合型纳米孔道,其属于生物和化学领域。生物纳米孔的定点功能化是单分子传感的关键,而引入非天然基团极其困难。本发明通过基因工程途径,将非天然基团,特别是将具有连接基团的非天然氨基酸引入生物纳米孔MspA中,并期借此途径,实现在生物纳米孔的任意氨基酸位点,引入任意数量目标基团的目的,从而实现生物纳米孔的通用连接性。在此基础上,将功能组分能够选择性地连接到生物纳米孔上,从而实现对单分子实时和动态连续监测的目的,极大地扩展了生物纳米孔的功能。
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公开(公告)号:CN117355746A
公开(公告)日:2024-01-05
申请号:CN202280034924.6
申请日:2022-05-12
Applicant: 南京大学
IPC: G01N27/447
Abstract: 一种在纳米孔系统中表征分析物或所述分析物与试剂之间的相互作用的方法,其中所述纳米孔系统包含设置在将第一导电液体介质与第二导电液体介质隔开的膜中的蛋白质纳米孔,其中所述蛋白质纳米孔是MspA、MspA同源物或其变体,其中所述分析物具有构象,并且具有所述构象的分析物可以容纳在所述MspA、所述MspA同源物或其变体的前庭中,但不能移位通过所述MspA、所述MspA同源物或其变体,所述方法包含:i)在所述第一导电液体介质和所述第二导电液体介质之间施加电位差以将所述分析物驱动到所述纳米孔中,并且任选地使所述试剂与所述分析物接触;ii)测量通过所述蛋白质纳米孔的离子电流以提供测试电流模式,所述模式至少含有在所述分析物处于所述MspA、所述MspA同源物或其变体的前庭内期间测量的离子电流;iii)将所述测试电流模式与所述分析物的至少一种特征或所述分析物与试剂之间的相互作用相关联。
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公开(公告)号:CN109295187A
公开(公告)日:2019-02-01
申请号:CN201811284679.6
申请日:2018-10-31
Applicant: 南京大学
IPC: C12Q1/6869
CPC classification number: C12Q1/6869 , C12Q2537/1376 , C12Q2525/101 , C12Q2565/631
Abstract: 本发明公开了一种基于纳米孔对非天然核酸直接测序的错位测序方法,包括以下步骤:(1)通过固相合成非天然核酸待测序链,通过酶促连接的方法,将非天然核酸待测序链与DNA引导测序链连接起来,作为完整的待测序链;(2)制备具有单分子分辨能力的纳米传感孔道;(3)将待测序链和DNA引物混合,变性退火构建测序文库,然后与核酸聚合酶一起加入纳米孔的cis室,在电场力作用下核酸链通过纳米孔,读取核酸链过孔时产生的电信号,解析信号得到序列。相对于现有技术,本发明利用低成本的、高效的纳米孔测序方法,首次对连续非天然核酸链实现直接测序。
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公开(公告)号:CN109295187B
公开(公告)日:2021-02-09
申请号:CN201811284679.6
申请日:2018-10-31
Applicant: 南京大学
IPC: C12Q1/6869
Abstract: 本发明公开了一种基于纳米孔对非天然核酸直接测序的错位测序方法,包括以下步骤:(1)通过固相合成非天然核酸待测序链,通过酶促连接的方法,将非天然核酸待测序链与DNA引导测序链连接起来,作为完整的待测序链;(2)制备具有单分子分辨能力的纳米传感孔道;(3)将待测序链和DNA引物混合,变性退火构建测序文库,然后与核酸聚合酶一起加入纳米孔的cis室,在电场力作用下核酸链通过纳米孔,读取核酸链过孔时产生的电信号,解析信号得到序列。相对于现有技术,本发明利用低成本的、高效的纳米孔测序方法,首次对连续非天然核酸链实现直接测序。
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