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公开(公告)号：CN102184284A
公开(公告)日：2011-09-14
申请号：CN201110112111.8
申请日：2011-04-29
Applicant: 南京大学
IPC: G06F17/50
Abstract: 本发明公开了一种有机污染物定量结构活性相关模型抽多法交互验证方法。本发明将均匀设计方法与留多法交互验证进行整合，以均匀设计优化的留多法交互验证(Uniform Design Optimized LMOCV，UDOLMOCV)的相关系数为变量筛选终止标准；同时在模型内部验证时，运用均匀设计优化的留多法交互验证对模型进行样本内部交叉验证，以为预测能力判断指标，提供更大的样本波动性，少量的样本抽样验证次数即可实现验证样本均匀分布样本空间，且每次抽取的样本具有很强的代表性。本发明所得验证样本具有很强的样本分布代表性，克服了Monte Carlo方法选取样本的单一方式。本发明可以不仅可以用于验证QSAR模型的稳定性和与预测能力，并且可以用于发现和确定模型中不稳定因素。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN102156791A
公开(公告)日：2011-08-17
申请号：CN201110110058.8
申请日：2011-04-29
Applicant: 南京大学
IPC: G06F17/50
Abstract: 本发明公开了污染物定量结构活性相关模型结构描述符筛选终止的方法。本发明将交叉验证相关系数q2和模型修正相关系数R2adj进行整合；对某一变量子集建立统计模型，获得观测值与模型估计值之间的相关系数r2、修正相关系数R2adj；对上述过程中的变量子集进行交叉验证，获得模型的交叉验证相关系数q2，所用的交叉验证方法有两种：留一法交互验证和留多法交互验证；根据上述过程得到的统计参数构造新参数QRadj；对同一系统新参数QRadj的数值越大，说明模型的稳定性越高，预测能力越强。本发明中的新标准QRadj不仅能够保证所获模型具有较高的交叉验证相关系数q2，而且可以避免过拟合现象的出现，杜绝筛选出低r2值高q2值的QSAR模型变量组合，科学描述模型的稳定性和预测能力。
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公开(公告)号：CN102156791B
公开(公告)日：2012-10-17
申请号：CN201110110058.8
申请日：2011-04-29
Applicant: 南京大学
IPC: G06F17/50
Abstract: 本发明公开了污染物定量结构活性相关模型结构描述符筛选终止的方法。本发明将交叉验证相关系数q2和模型修正相关系数R2adj进行整合；对某一变量子集建立统计模型，获得观测值与模型估计值之间的相关系数r2、修正相关系数R2adj；对上述过程中的变量子集进行交叉验证，获得模型的交叉验证相关系数q2，所用的交叉验证方法有两种：留一法交互验证和留多法交互验证；根据上述过程得到的统计参数构造新参数QRadj；对同一系统新参数QRadj的数值越大，说明模型的稳定性越高，预测能力越强。本发明中的新标准QRadj不仅能够保证所获模型具有较高的交叉验证相关系数q2，而且可以避免过拟合现象的出现，杜绝筛选出低r2值高q2值的QSAR模型变量组合，科学描述模型的稳定性和预测能力。
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公开(公告)号：CN101059520A
公开(公告)日：2007-10-24
申请号：CN200710022972.0
申请日：2007-05-29
Applicant: 南京大学
IPC: G01N33/74
Abstract: 本发明公开了一种基于受体结合模式的有机物ER亲合力快速筛选预测方法。根据已有ER亲合力数据污染物与受体结合能、氢键作用模式和到达受体作用位点难易程度等受体结合模式与亲合力指标的关系建立基于受体结构的QSAR判别模型与预测模型，并将其应用到ER亲合力未知化合物的ER亲合力判别预测。采用本发明方法筛选预测环境可疑EDCs和激素受体亲合力的强弱，对很宽范围活性指标的结构各异化合物均可进行判别筛选与预测，方法成本低廉、简便可靠，能够节省大量的人力、物力、财力，平均预测能力达到80％以上，预测结果对相应化合物的环境管理和生态风险评价具有重要的指导意义。
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公开(公告)号：CN101381894B
公开(公告)日：2013-03-06
申请号：CN200810123727.3
申请日：2008-05-30
Applicant: 南京大学
IPC: C40B30/02
Abstract: 本发明公开了一种有机物雌激素受激动和拮抗体作用的识别方法。利用分子动力学手段，计算与分析有机物与雌激素受体结合过程，基于配体结合方式和雌激素配体结合区构象的变化，特别是ER的LBD结构中H12螺旋位置的变化，识别有机物是ER激动剂还是拮抗剂。本发明可以有效识别有机物的拟/抗雌激素作用，方法成本低廉简便，能够节省大量的人力物力财力，为大规模开展毒害化学品环境安全性评价(REACH)进行提供相应的基础工具与快捷途径。
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公开(公告)号：CN101381894A
公开(公告)日：2009-03-11
申请号：CN200810123727.3
申请日：2008-05-30
Applicant: 南京大学
IPC: C40B30/02
Abstract: 本发明公开了一种有机物雌激素受激动和拮抗体作用的识别方法。利用分子动力学手段，计算与分析有机物与雌激素受体结合过程，基于配体结合方式和雌激素配体结合区构象的变化，特别是ER的LBD结构中H12螺旋位置的变化，识别有机物是ER激动剂还是拮抗剂。本发明可以有效识别有机物的拟/抗雌激素作用，方法成本低廉简便，能够节省大量的人力物力财力，为大规模开展毒害化学品环境安全性评价(REACH)进行提供相应的基础工具与快捷途径。
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