公开(公告)号：CN112176070B

公开(公告)日：2022-04-19

申请号：CN202010765498.6

申请日：2020-08-03

Applicant: 南京农业大学 ,  常州市枫华牧业有限公司

Inventor： 吴望军 ,  李荣阳 ,  张增凯 ,  刘红林 ,  黄小国

IPC: C12Q1/6888 ,  C12N15/11 ,  C12N15/12

Abstract: 本发明公开了一种与猪肌内脂肪性状相关的UCP3基因、分子标记及其应用，该SNP分子标记为位于如SEQ ID NO：6所示序列的2159bp处的G/T突变，其基因组位置位于猪11.1版本第9号染色体从5’端起的8387309位点。本发明首先在279头试验猪群中利用FastTarget目标区域测序技术在该基因中鉴定了一个影响猪肌内脂肪含量的变异位点，并建立了针对该位点的PCR‑RsaI‑RFLP基因快速分型方法；在此基础上，本发明在500头试验猪群中对该位点提高肌内脂肪的应用效果进行了验证，结果表明通过该位点有利基因型的选择可显著提高猪群肌内脂肪含量，所鉴定的变异位点可用于种猪肌内脂肪的早期、活体、快速的标记辅助选育。

公开(公告)号：CN107267627B

公开(公告)日：2021-04-20

申请号：CN201710565071.X

申请日：2017-07-12

Applicant: 南京农业大学

Inventor： 吴望军 ,  刘红林 ,  刘凯清 ,  李伯江 ,  董超 ,  张增凯

IPC: C12Q1/6888 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明属于猪标记辅助选择(MAS)技术领域，公开了与猪生产性状相关的Six1基因分子标记的制备与应用。该分子标记选自(1)～(2)中的至少一种：(1)其DNA序列如序列表SEQ ID NO：2所示，在序列表SEQ ID NO：2所示序列的第11bp处有1个A11‑G11突变，导致HindII‑RFLP多态性；(2)其DNA序列如序列表SEQ ID NO：13所示，在序列表SEQ ID NO：13所示序列的第11bp处有1个(AC)n微卫星变异，n表示(AC)重复数。通过群体数据关联分析，启动子活性，以及基因表达分析，证实了两个分子标记与猪生产性状呈显著相关。本发明所建立的分子标记的制备方法和应用可用于猪相关生产性状的分子选育。

公开(公告)号：CN109706159A

公开(公告)日：2019-05-03

申请号：CN201811542502.1

申请日：2018-12-17

Applicant: 南京农业大学

Inventor： 吴望军 ,  李伯江 ,  刘红林 ,  董超 ,  张增凯 ,  陈禹均

IPC: C12N15/54 ,  C12N9/10 ,  C12Q1/6888 ,  C12Q1/6851

Abstract: 本发明公开了一种肌内脂肪沉积FASN基因及其应用，从杜洛克×梅山杂交猪的背最长肌组织分离、克隆了与肌内脂肪相关的脂肪酸合成酶(fatty acid synthase，FASN)基因，其长度为8127bp，包括7539bp CDS、97bp 5’UTR及491bp 3’UTR，其核苷酸序列如SEQ.ID.NO.1；CDS核苷酸序列如SEQ.ID.NO.2；编码的氨基酸序列为SEQ.ID.NO.3。检测结果显示FASN基因在脂肪组织中极其高表达。FASN基因与肌内脂肪含量的相关性检测结果表明FASN基因表达水平在高肌内脂肪个体中显著高于其在低肌内脂肪个体。本发明可以为今后猪肌内脂肪含量性状的选育提供了分子基础。

公开(公告)号：CN109576276B

公开(公告)日：2022-09-27

申请号：CN201811549514.7

申请日：2018-12-18

Applicant: 南京农业大学

Inventor： 吴望军 ,  董超 ,  刘红林 ,  张增凯 ,  陈禹均 ,  张锡英

IPC: C12N15/12 ,  C12N15/113 ,  C12N15/11 ,  C12Q1/6888

Abstract: 本发明属于家畜分子生物学技术与遗传育种领域，公开了猪肉质性状相关基因Prox1的分子克隆及应用，利用双荧光酶活性分析技术确定了猪Prox1基因启动子区活性区，在‑1182/‑1957bp区域存在影响启动子活性的正调控元件；而在‑1182/‑682bp区域、‑682/‑192bp区域，以及‑192到+122bp区域均存在影响启动子活性的负调控元件。本发明在猪Prox1基因启动子序列中鉴定了18个遗传变异位点，并证明其中三个完全连锁的遗传变异位点与猪肉pH性状存在显著相关，可作为猪生产性状辅助选育的重要分子标记。

公开(公告)号：CN112176070A

公开(公告)日：2021-01-05

申请号：CN202010765498.6

申请日：2020-08-03

Applicant: 南京农业大学 ,  常州市枫华牧业有限公司

Inventor： 吴望军 ,  李荣阳 ,  张增凯 ,  刘红林 ,  黄小国

IPC: C12Q1/6888 ,  C12N15/11 ,  C12N15/12

Abstract: 本发明公开了一种与猪肌内脂肪性状相关的UCP3基因、分子标记及其应用，该SNP分子标记为位于如SEQ ID NO：6所示序列的2159bp处的G/T突变，其基因组位置位于猪11.1版本第9号染色体从5’端起的8387309位点。本发明首先在279头试验猪群中利用FastTarget目标区域测序技术在该基因中鉴定了一个影响猪肌内脂肪含量的变异位点，并建立了针对该位点的PCR‑RsaI‑RFLP基因快速分型方法；在此基础上，本发明在500头试验猪群中对该位点提高肌内脂肪的应用效果进行了验证，结果表明通过该位点有利基因型的选择可显著提高猪群肌内脂肪含量，所鉴定的变异位点可用于种猪肌内脂肪的早期、活体、快速的标记辅助选育。

公开(公告)号：CN109576276A

公开(公告)日：2019-04-05

申请号：CN201811549514.7

申请日：2018-12-18

Applicant: 南京农业大学

Inventor： 吴望军 ,  董超 ,  刘红林 ,  张增凯 ,  陈禹均 ,  张锡英

IPC: C12N15/12 ,  C12N15/113 ,  C12N15/11 ,  C12Q1/6888

Abstract: 本发明属于家畜分子生物学技术与遗传育种领域，公开了猪肉质性状相关基因Prox1的分子克隆及应用，利用RACE技术克隆出猪Prox1基因全长cDNA序列，其序列全长3683bp，序列特征如SEQ ID NO:4所示。利用双荧光酶活性分析技术确定了猪Prox1基因启动子区活性区，在-1182/-1957bp区域存在影响启动子活性的正调控元件；而在-1182/-682bp区域、-682/-192bp区域，以及-192到+122bp区域均存在影响启动子活性的负调控元件。群体样本表达模式表明，猪Prox1基因是一个与肉色显著相关的基因，可作为肉色分级的标记基因。另外，本发明在猪Prox1基因启动子序列中鉴定了18个遗传变异位点，并证明其中三个完全连锁的遗传变异位点与猪肉pH性状存在显著相关，可作为猪生产性状辅助选育的重要分子标记。

公开(公告)号：CN107267627A

公开(公告)日：2017-10-20

申请号：CN201710565071.X

申请日：2017-07-12

Applicant: 南京农业大学

Inventor： 吴望军 ,  刘红林 ,  刘凯清 ,  李伯江 ,  董超 ,  张增凯

IPC: C12Q1/68 ,  C12N15/11

CPC classification number: C12Q1/6888 ,  C12Q2600/124 ,  C12Q2600/156

Abstract: 本发明属于猪标记辅助选择(MAS)技术领域，公开了与猪生产性状相关的Six1基因分子标记的制备与应用。该分子标记选自(1)～(2)中的至少一种：(1)其DNA序列如序列表SEQ ID NO：2所示，在序列表SEQ ID NO：2所示序列的第11bp处有1个A11-G11突变，导致HindII-RFLP多态性；(2)其DNA序列如序列表SEQ ID NO：13所示，在序列表SEQ ID NO：13所示序列的第11bp处有1个(AC)n微卫星变异，n表示(AC)重复数。通过群体数据关联分析，启动子活性，以及基因表达分析，证实了两个分子标记与猪生产性状呈显著相关。本发明所建立的分子标记的制备方法和应用可用于猪相关生产性状的分子选育。