一种基于多组学高效挖掘调控大豆粒重的长链非编码RNA的方法及其应用技术

    公开(公告)号:CN120048350A

    公开(公告)日:2025-05-27

    申请号:CN202510245422.3

    申请日:2025-03-04

    Abstract: 本发明提供了一种基于多组学高效挖掘调控大豆粒重的长链非编码RNA的方法及其应用技术,属于植物分子育种领域;所述方法包括以下步骤:1) 收集大豆自然种质资源,进行表型检测,并提取所有样品的DNA和RNA;2) 利用所述样品的DNA和RNA分别构建重测序文库、转录组文库,上机测序;3) 从所述的重测序数据中进行SNP的鉴定;从所述的转录组数据中进行lncRNA表达的计算;4) 使用转录组关联分析方法,皮尔森相关性或斯皮尔曼相关性计算lncRNA表达和上述种质资源的百粒重进行关联分析,筛选到显著关联粒重的lncRNAs;5) 将SNP数据和lncRNA表达数据进行关联,解析其遗传调控位点。所述方法能够为作物遗传育种提供新的基因资源,具有重要的理论和实际价值,对于新品种的开发具有重要意义。

    基于机器学习的耐盐大豆全基因组选择方法、系统及应用

    公开(公告)号:CN119889448A

    公开(公告)日:2025-04-25

    申请号:CN202411970185.9

    申请日:2024-12-30

    Abstract: 本发明公开了一种基于机器学习的耐盐大豆全基因组选择方法,所述方法包括以下步骤:1)获取用于建模的数据集的基因型和盐处理后表型,并进行处理;2)对SNP位点和缺失样品进行严格质控;3)对所述有效变异位点进行全基因组关联分析,获得高质量变异位点;4)将所述训练集中的高质量变异位点数据导入CA注意力机制和多重残差模块的卷积神经网络建立模型;5)确定最优模型;6)获取待测盐胁迫表型的大豆群体的重测序数据,提取其高质量变异位点,利用最优模型进行盐胁迫表型预测。本发明能够有效预测大豆盐胁迫表型,降低田间选育成本,显著提高耐盐大豆育种效率。

    与大豆油脂合成相关的编码基因HOIL2及其应用

    公开(公告)号:CN119331064A

    公开(公告)日:2025-01-21

    申请号:CN202411467876.7

    申请日:2024-10-21

    Abstract: 本发明公开了大豆编码基因HOIL2及其在调控大豆种子油份含量中的应用。本发明提供的蛋白质,是如下(a)、(b)或(c):(a)由SEQ ID NO.1所示的氨基酸序列组成的蛋白质;(b)将SEQ ID NO.1所示的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加且与植物种子油脂含量相关的由SEQ ID NO.1衍生的蛋白质;(c)由与SEQ ID NO.1所示的氨基酸序列至少具有75%同源性的氨基酸序列组成且与植物种子油脂含量相关的蛋白质。本发明所涉及的调控蛋白及其编码基因对提高植物种子油脂含量,培育高油植物品种具有重要意义。

    与大豆油脂合成相关的编码基因HOIL1及其应用

    公开(公告)号:CN119320437A

    公开(公告)日:2025-01-17

    申请号:CN202411467875.2

    申请日:2024-10-21

    Abstract: 本发明公开了大豆编码基因HOIL1及其在调控大豆种子油份含量中的应用。本发明提供的蛋白质,是如下(a)、(b)或(c):(a)由SEQ ID NO.1所示的氨基酸序列组成的蛋白质;(b)将SEQ ID NO.1所示的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加且与植物种子油脂含量相关的由SEQ ID NO.1衍生的蛋白质;(c)由与SEQ ID NO.1所示的氨基酸序列至少具有75%同源性的氨基酸序列组成且与植物种子油脂含量相关的蛋白质。本发明所涉及的调控蛋白及其编码基因对提高植物种子油脂含量,培育高油植物品种具有重要意义。

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