基于深度学习融合分子图及指纹的药物性质预测方法及系统

    公开(公告)号:CN115050428B

    公开(公告)日:2024-06-14

    申请号:CN202210654644.7

    申请日:2022-06-10

    Abstract: 本发明公开基于深度学习融合分子图及指纹的药物性质预测方法及系统。该预测方法为:对于不同药物性质的预测;构建适用于药物性质预测的深度学习模型;根据模型构建的需求,选择具体方式,将数据集拆分为为训练集、测试集和验证集;将数据集输入网络模型中,根据训练集预测结果和训练集真值的差距对网络中的参数进行训练更新,根据验证集上的最优结果确定最优网络参数,对测试集数据进行检测;根据超参数优化策略,确定模型的最优超参数组合;对于不同药物性质的预测,生成针对性的最优模型,以供后续应用于新的小分子药物性质预测。本发明融合了经典的分子指纹特征,解决了深度学习在小规模数据集上无法有效提取到重要特征的缺陷。

    基于深度学习融合分子图及指纹的药物性质预测方法及系统

    公开(公告)号:CN115050428A

    公开(公告)日:2022-09-13

    申请号:CN202210654644.7

    申请日:2022-06-10

    Abstract: 本发明公开基于深度学习融合分子图及指纹的药物性质预测方法及系统。该预测方法为:对于不同药物性质的预测;构建适用于药物性质预测的深度学习模型;根据模型构建的需求,选择具体方式,将数据集拆分为为训练集、测试集和验证集;将数据集输入网络模型中,根据训练集预测结果和训练集真值的差距对网络中的参数进行训练更新,根据验证集上的最优结果确定最优网络参数,对测试集数据进行检测;根据超参数优化策略,确定模型的最优超参数组合;对于不同药物性质的预测,生成针对性的最优模型,以供后续应用于新的小分子药物性质预测。本发明融合了经典的分子指纹特征,解决了深度学习在小规模数据集上无法有效提取到重要特征的缺陷。

    以吡唑并[3,4-b]吡啶-6-酮为骨架的新型抗肿瘤先导化合物及其筛选方法与应用

    公开(公告)号:CN110305127A

    公开(公告)日:2019-10-08

    申请号:CN201910548049.3

    申请日:2019-06-24

    Inventor: 王领 罗瑶 郭轻轻

    Abstract: 本发明公开了以吡唑并[3,4-b]吡啶-6-酮为骨架的新型抗肿瘤先导化合物及其筛选方法与应用。该方法包括:对ChemDiv化合物库进行去除重复、能量优化及Lipinski五原则筛选后,用NCI-60活性预测模型进行活性预测,对ADMET性质及一致性的打分筛选;通过骨架多样性分析、经验筛选及一致性打分对化合物进一步筛选;最后对筛选出的化合物进行MTT测试。筛选出所述以吡唑并[3,4-b]吡啶-6-酮为骨架的新型抗肿瘤先导化合物。本发明提供的以吡唑并[3,4-b]吡啶-6-酮为骨架的新型抗肿瘤先导化合物,对多种肿瘤细胞系均具有抗肿瘤活性,对肿瘤细胞微管影响明显,能够阻滞癌细胞的细胞周期于G2/M期,诱导细胞凋亡。

    一种化合物分子间相似度的计算方法及系统与它们的应用

    公开(公告)号:CN108205613A

    公开(公告)日:2018-06-26

    申请号:CN201711308883.2

    申请日:2017-12-11

    Abstract: 本发明公开了一种化合物分子间相似度的计算方法及系统与它们的应用。该计算方法包括如下步骤:(1)计算化合物分子的3D分子相似度;(2)计算化合物分子的2D分子相似度;(3)结合3D与2D分子相似度,运用数学运算,得到杂交分子相似度。基于所述计算方法的化合物分子间相似度的计算系统,包括3D分子相似度计算模块、2D分子相似度计算模块以及数学运算模块。本发明的计算方法全面从2D与3D角度考虑分子间的相似度,具有计算准确度高,能够体现化合物的结构片段信息,能够实现化合物的骨架跃迁等优点,在计算机辅助药物设计中具有良好的应用前景。

    一类苄基噻唑胺类化合物及其制备方法与抗肿瘤应用

    公开(公告)号:CN114874155B

    公开(公告)日:2024-02-06

    申请号:CN202210505442.6

    申请日:2022-05-10

    Abstract: 本发明公开了一类苄基噻唑胺类化合物及其制备方法与抗肿瘤应用。所述化合物具体包括N‑(5‑(3‑氯苄基)噻唑‑2‑基)‑4‑甲基苯甲酰胺和N‑(5‑(4‑甲氧基苄基)噻唑‑2‑基)庚酰胺两种苄基噻唑胺类化合物。该类化合物表现出对多种肿瘤细胞良好的抗增殖活性,在抗肿瘤领域具有广阔应用前景;同时,本发明的化合物N‑(5‑(3‑氯苄基)噻唑‑2‑基)‑4‑甲基苯甲酰胺和N‑(5‑(4‑甲氧基苄基)噻唑‑2‑基)庚酰胺的制备方法简单,设备要求较低,有利于实现大规模生产。

    一类苄基噻唑胺类化合物及其制备方法与抗肿瘤应用

    公开(公告)号:CN114874155A

    公开(公告)日:2022-08-09

    申请号:CN202210505442.6

    申请日:2022-05-10

    Abstract: 本发明公开了一类苄基噻唑胺类化合物及其制备方法与抗肿瘤应用。所述化合物具体包括N‑(5‑(3‑氯苄基)噻唑‑2‑基)‑4‑甲基苯甲酰胺和N‑(5‑(4‑甲氧基苄基)噻唑‑2‑基)庚酰胺两种苄基噻唑胺类化合物。该类化合物表现出对多种肿瘤细胞良好的抗增殖活性,在抗肿瘤领域具有广阔应用前景;同时,本发明的化合物N‑(5‑(3‑氯苄基)噻唑‑2‑基)‑4‑甲基苯甲酰胺和N‑(5‑(4‑甲氧基苄基)噻唑‑2‑基)庚酰胺的制备方法简单,设备要求较低,有利于实现大规模生产。

    化合物二甲氧基苯乙烯基-氨基-苯并咪唑基-三嗪及其盐与制备方法及应用

    公开(公告)号:CN108148063B

    公开(公告)日:2020-07-28

    申请号:CN201711336262.5

    申请日:2017-12-11

    Inventor: 王领 曾然然 罗瑶

    Abstract: 本发明公开了化合物二甲氧基苯乙烯基‑氨基‑苯并咪唑基‑三嗪及其盐与制备方法及应用。本发明的化合物2‑[(E)‑3’,4’‑二甲氧基苯乙烯基]‑4‑氨基‑[1.2]‑苯并咪唑基‑[1,3,5]三嗪对多种肿瘤细胞系的抗肿瘤活性好,对肿瘤细胞微管的影响明显,且对细胞微管的作用与时间和浓度均呈正相关性,在抗肿瘤领域具有广阔应用前景;同时,本发明的化合物2‑[(E)‑3’,4’‑二甲氧基苯乙烯基]‑4‑氨基‑[1.2]‑苯并咪唑基‑[1,3,5]三嗪制备方法工艺简单,设备要求低,有利于实现大规模生产。

    化合物二甲氧基苯乙烯基-氨基-苯并咪唑基-三嗪及其盐与制备方法及应用

    公开(公告)号:CN108148063A

    公开(公告)日:2018-06-12

    申请号:CN201711336262.5

    申请日:2017-12-11

    Inventor: 王领 曾然然 罗瑶

    Abstract: 本发明公开了化合物二甲氧基苯乙烯基-氨基-苯并咪唑基-三嗪及其盐与制备方法及应用。本发明的化合物2-[(E)-3’,4’-二甲氧基苯乙烯基]-4-氨基-[1.2]-苯并咪唑基-[1,3,5]三嗪对多种肿瘤细胞系的抗肿瘤活性好,对肿瘤细胞微管的影响明显,且对细胞微管的作用与时间和浓度均呈正相关性,在抗肿瘤领域具有广阔应用前景;同时,本发明的化合物2-[(E)-3’,4’-二甲氧基苯乙烯基]-4-氨基-[1.2]-苯并咪唑基-[1,3,5]三嗪制备方法工艺简单,设备要求低,有利于实现大规模生产。

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