公开(公告)号：CN108427865B

公开(公告)日：2022-04-22

申请号：CN201810209311.7

申请日：2018-03-14

Applicant: 华南理工大学

Inventor： 周杰 ,  徐展良

IPC: G16B40/20 ,  G16B50/30 ,  G16B20/00

Abstract: 本发明公开了一种预测LncRNA和环境因素关联关系的方法，包括：S1、根据已知的LncRNA‑环境因素关联关系网络的邻接矩阵，分别计算出LncRNA的高斯相互作用属性核相似矩阵KL和环境因素的高斯相互作用属性核相似矩阵KE；S2、把KL和KE通过拉普拉斯算子进行归一化；S3、在LncRNA空间和环境因素空间中分别定义成本函数，通过最小化该成本函数，分别得到LncRNA空间和环境因素空间的最优分类器；S4、将得到的两种最优分类器转化为统一空间的分类器，用于计算LncRNA‑环境因素关联关系的概率，根据概率对LncRNA‑环境因素关联关系进行排名，概率值越高说明该LncRNA‑环境因素的关联关系越强。所述方法有效解决了生物实验方法的盲目性、成本高问题，对生物学家的实验研究起到了指导的作用。

公开(公告)号：CN108427865A

公开(公告)日：2018-08-21

申请号：CN201810209311.7

申请日：2018-03-14

Applicant: 华南理工大学

Inventor： 周杰 ,  徐展良

IPC: G06F19/18 ,  G06F19/24

Abstract: 本发明公开了一种预测LncRNA和环境因素关联关系的方法，包括：S1、根据已知的LncRNA-环境因素关联关系网络的邻接矩阵，分别计算出LncRNA的高斯相互作用属性核相似矩阵KL和环境因素的高斯相互作用属性核相似矩阵KE；S2、把KL和KE通过拉普拉斯算子进行归一化；S3、在LncRNA空间和环境因素空间中分别定义成本函数，通过最小化该成本函数，分别得到LncRNA空间和环境因素空间的最优分类器；S4、将得到的两种最优分类器转化为统一空间的分类器，用于计算LncRNA-环境因素关联关系的概率，根据概率对LncRNA-环境因素关联关系进行排名，概率值越高说明该LncRNA-环境因素的关联关系越强。所述方法有效解决了生物实验方法的盲目性、成本高问题，对生物学家的实验研究起到了指导的作用。