公开(公告)号：CN110176274B

公开(公告)日：2023-03-10

申请号：CN201910386174.9

申请日：2019-05-09

Applicant: 温氏食品集团股份有限公司 ,  华南农业大学

Inventor： 蔡更元 ,  董林松 ,  吴珍芳

IPC: G16B20/20 ,  G16B20/30 ,  C12Q1/6888

Abstract: 本发明公开了一种基于全基因组SNP信息对种猪进行血统划分的方法。先对划分对象采集身体组织，提取DNA，通过某种基因分型技术对每个体的基因组SNP进行分型，通过质控，筛选出合格的SNP位点。通过基因组SNP基因型计算个体间的加性遗传相关值，然后用1减去该值作为两两个体之间的“距离”，接下来对两两组合通过R语言“hclust”函数进行聚类分析，取0.9844作为划分血统的阈值。本发明相对传统血统划分方法，得到的结果清晰简洁，并且充分吸收了来自父母双方传递的等位基因信息，对血统的划分具有更高的可靠性。

公开(公告)号：CN110176274A

公开(公告)日：2019-08-27

申请号：CN201910386174.9

申请日：2019-05-09

Applicant: 温氏食品集团股份有限公司 ,  华南农业大学

Inventor： 蔡更元 ,  董林松 ,  吴珍芳

IPC: G16B20/20 ,  G16B20/30 ,  C12Q1/6888

Abstract: 本发明公开了一种基于全基因组SNP信息对种猪进行血统划分的方法。先对划分对象采集身体组织，提取DNA，通过某种基因分型技术对每个体的基因组SNP进行分型，通过质控，筛选出合格的SNP位点。通过基因组SNP基因型计算个体间的加性遗传相关值，然后用1减去该值作为两两个体之间的“距离”，接下来对两两组合通过R语言“hclust”函数进行聚类分析，取0.9844作为划分血统的阈值。本发明相对传统血统划分方法，得到的结果清晰简洁，并且充分吸收了来自父母双方传递的等位基因信息，对血统的划分具有更高的可靠性。

公开(公告)号：CN119331991A

公开(公告)日：2025-01-21

申请号：CN202411766485.5

申请日：2024-12-04

Applicant: 华南农业大学

Inventor： 吴珍芳 ,  杨杰 ,  邱益彬 ,  郑恩琴 ,  左建军 ,  姚泽锴 ,  刘琅青 ,  蔡更元 ,  刘珍云 ,  董林松 ,  郭才金 ,  吴家劲

IPC: C12Q1/6888 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明公开一种位于猪4号染色体上与腰围相关的SNP分子标记及其应用，所述SNP分子标记的位点位于SEQ ID NO:1所示核苷酸序列从5’端起的第134位，对应于国际猪参考基因组11.1版本4号染色体上第22721111bp处，该位点存在C>T突变。本发明提供的SNP分子标记与猪的腰围性状显著相关，通过鉴定该SNP分子标记的基因型，可实现猪腰围性状的鉴定，而通过选育SNP分子标记基因型为CC的猪，可以加快猪的选育进程，实现猪的遗传改良。