公开(公告)号：CN114807333A

公开(公告)日：2022-07-29

申请号：CN202210609250.X

申请日：2022-05-31

Applicant: 华南农业大学

Inventor： 杨化强 ,  吴珍芳 ,  何健宇 ,  杨杰 ,  赵鑫 ,  蔡更元 ,  张献伟

IPC: C12Q1/6869 ,  C12Q1/6888 ,  C12N15/85 ,  A01K67/027 ,  G16B20/20

Abstract: 本发明公开了一种识别基因编辑动物全基因组变异的方法。通过分析供体细胞和基因编辑后新生克隆猪的全基因组，使用mutect2、strelka2和/或lofreq分析识别基因编辑造成的全基因组范围内的变异位点。本发明的分析方法用以分析全基因组范围内的所有突变，不以sgRNA同源性预测作为依据，能最大限度地检测所有存在的变异位点；以无偏的方式直接分析基因编辑猪与供体细胞的基因差异，不受遗传学影响，且操作方便，高效处理批量样品；适用于所有克隆动物全基因组比较分析，适用于任何工具和方法对供体细胞造成变异的检测，包括克隆操作自身对克隆动物造成变异的检测。