跨模态神经元图像的自动匹配方法

    公开(公告)号:CN119048771A

    公开(公告)日:2024-11-29

    申请号:CN202411007061.0

    申请日:2024-07-25

    Abstract: 本发明提供一种跨模态神经元图像的自动匹配方法,用于将二维的双光子细胞图像与三维的fMOST细胞图像上对应的神经元进行匹配,包括:步骤S1.fMOST细胞图像库构建;步骤S2.双光子细胞图像前处理;步骤S3.细胞图像匹配。本发明跨模态神经元图像的自动匹配方法,利用三维的fMOST细胞图像构建二维的fMOST细胞图像库,基于局部细胞图像相似度,实现了双光子细胞图像和fMOST细胞图像的自动匹配,不需要人工介入,不依赖人的经验,也不受人的主观性的影响,而且准确性较高,而且能够用于标记较密的脑图像数据。

    一种快速且精准地获取组织样本神经元胞体位置的方法

    公开(公告)号:CN110458923B

    公开(公告)日:2022-11-04

    申请号:CN201811295425.4

    申请日:2018-11-01

    Abstract: 本发明公开了一种快速且精准地获取组织样本神经元胞体位置的方法,然后在下一轮切割及成像过程中获得已完成成像及切割的部分或全部厚度的表层图像的细胞位置信息,且下一轮切割及成像时间大于获得已完成成像及切割的部分或全部厚度的表层图像的细胞位置信息的时间且小于获得已完成成像及切割的部分或全部厚度的表层图像的细胞位置信息的时间的5倍,使得整个样本切割及成像完成后,只需要花费很少的时间完成最后一批表层图像中的胞体位置信息及整个组织样本的神经元胞体位置信息,从而大大缩短获得整个组织样本的神经元胞体位置信息的时间。

    显微光学图像的脑区扩张校正方法

    公开(公告)号:CN110599529A

    公开(公告)日:2019-12-20

    申请号:CN201910853269.7

    申请日:2019-09-10

    Abstract: 本发明提供一种显微光学图像的脑区扩张校正方法,所述方法包括如下步骤:步骤S1,区域特征提取及三维表面重建;步骤S2,点云非线性配准;步骤S3,图像非线性配准;步骤S4,高分辨非线性配准。本发明首先基于点云非线性配准,确定脑组织形变的强度和拉伸方向,然后利用薄板样条非线性形变模型,结合点云数据获取的强度和方向信息,构造非线性形变场。由于薄板样条模型可以构造出全局范围、拉伸均匀的形变,因此可以避免传统非线性配准计算中形变仅发生在脑室周边的问题,使得脑室周围的图像形变能够符合生物组织形变的真实情况,避免过度拉伸。

    一种快速且精准地获取组织样本神经元胞体位置的方法

    公开(公告)号:CN110458923A

    公开(公告)日:2019-11-15

    申请号:CN201811295425.4

    申请日:2018-11-01

    Abstract: 本发明公开了一种快速且精准地获取组织样本神经元胞体位置的方法,然后在下一轮切割及成像过程中获得已完成成像及切割的部分或全部厚度的表层图像的细胞位置信息,且下一轮切割及成像时间大于获得已完成成像及切割的部分或全部厚度的表层图像的细胞位置信息的时间且小于获得已完成成像及切割的部分或全部厚度的表层图像的细胞位置信息的时间的5倍,使得整个样本切割及成像完成后,只需要花费很少的时间完成最后一批表层图像中的胞体位置信息及整个组织样本的神经元胞体位置信息,从而大大缩短获得整个组织样本的神经元胞体位置信息的时间。

    一种结构光快速扫描显微成像方法

    公开(公告)号:CN103207449B

    公开(公告)日:2015-04-29

    申请号:CN201310131718.X

    申请日:2013-04-17

    Abstract: 本发明涉及一种结构光快速扫描显微成像方法,包括以下步骤:(1)计算机控制空间光调制器产生单一空间频率的调制图案,投影在样本断层上;(2)在调制图案相位不变的情况下,电控移动平台带动样本移动,并同步触发线阵相机进行拍照;(3)改变调制图案相位,再对相同成像区域进行扫描,直到完成结构光成像所需不同照明相位图像的获取;(4)移动样本,对下一个相邻成像区域执行步骤(2)至步骤(4),直至完成整个样本断层的扫描。本发明每一次扫描运动前进行一次相位改变,降低了成像对调制器速度和鲁棒性要求;单次扫描运动中采集完整图像,相邻的图像只有部分重叠。样本运动和相机曝光同步进行,节省时间提高成像的速度。

    一种适用于超薄切片和荧光成像的生物样品制备方法

    公开(公告)号:CN102620966A

    公开(公告)日:2012-08-01

    申请号:CN201210092666.5

    申请日:2012-03-31

    Abstract: 本发明涉及一种适用于超薄切片和荧光成像的生物样品制备方法,属于生物工程技术领域。本发明采用4%多聚甲醛对荧光蛋白标记的生物组织进行固定,样品经0.01mol/L PBS溶液漂洗后,用乙醇溶液进行递度脱水,但脱水浓度不超过95%。之后,样品用改良后的乙二醇甲基丙烯酸酯(GMA)进行渗透及包埋。该方法所得包埋的生物样品具备进行连续超薄切片的硬度且能同时保持荧光信号。本发明方法成本低廉,操作步骤简单,适合在一般实验室推广使用。

    面向介观水平显微光学脑图谱的映射方法

    公开(公告)号:CN117557603A

    公开(公告)日:2024-02-13

    申请号:CN202311523307.5

    申请日:2023-11-15

    Abstract: 本发明提供一种面向介观水平显微光学脑图谱的映射方法,用于将第二脑图谱向第一脑图谱映射,包括:步骤一,构建多层级模型;步骤二,对第一层级的脑区图像进行映射,将名称相同的第一脑图谱中第一层级的脑区图像与第二脑图谱中第一层级的脑区图像进行配准,获得第一层级形变场;步骤三,对第二层级的脑区图像进行映射,将名称相同的第一脑图谱中第二层级的脑区图像与第二脑图谱中第二层级的脑区图像进行配准,获得第二层级形变场;步骤四,以此类推,对第三层级以及以下所有各层级的脑区图像,执行类似步骤三的操作,获得各层级形变场。本发明能够实现介观水平不同脑图谱脑之间映射对齐。

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