公开(公告)号：CN110570909A

公开(公告)日：2019-12-13

申请号：CN201910859461.7

申请日：2019-09-11

Applicant: 华中农业大学

Inventor： 刘建晓 ,  杨晨 ,  高辉 ,  杨轩 ,  黄穗宇 ,  阚裕隆

IPC: G16B40/00 ,  G16B20/00 ,  G06N3/00 ,  G06K9/62

Abstract: 本发明涉及生物信息技术领域，提供了一种人工蜂群优化贝叶斯网络的上位性位点挖掘方法，包括S1-S4四个步骤。本发明的一种人工蜂群优化贝叶斯网络的上位性位点挖掘方法，首先利用扩张、收缩、对称性检测三个阶段，通过条件互信息计算得到节点的马尔可夫毯，构建初始蜜源网络结构，然后，基于初始蜜源通过随机加边、减边、逆转边3种操作生成新的蜜源，直到达到最大初始蜜源数目，利用人工蜂群算法的三种操作(采蜜蜂、观察蜂和侦察蜂)与贝叶斯网络的BIC与MIT打分方法，对贝叶斯网络结构进行演化，找到最优的网络结构，快速准确的获取到影响表型性状的上位性基因位点，辅助基因功能挖掘。

公开(公告)号：CN110570909B

公开(公告)日：2023-03-03

申请号：CN201910859461.7

申请日：2019-09-11

Applicant: 华中农业大学

Inventor： 刘建晓 ,  杨晨 ,  高辉 ,  杨轩 ,  黄穗宇 ,  阚裕隆

IPC: G16B40/20 ,  G16B20/40 ,  G16B20/20 ,  G06N7/01 ,  G06N3/006

Abstract: 本发明涉及生物信息技术领域，提供了一种人工蜂群优化贝叶斯网络的上位性位点挖掘方法，包括S1‑S4四个步骤。本发明的一种人工蜂群优化贝叶斯网络的上位性位点挖掘方法，首先利用扩张、收缩、对称性检测三个阶段，通过条件互信息计算得到节点的马尔可夫毯，构建初始蜜源网络结构，然后，基于初始蜜源通过随机加边、减边、逆转边3种操作生成新的蜜源，直到达到最大初始蜜源数目，利用人工蜂群算法的三种操作(采蜜蜂、观察蜂和侦察蜂)与贝叶斯网络的BIC与MIT打分方法，对贝叶斯网络结构进行演化，找到最优的网络结构，快速准确的获取到影响表型性状的上位性基因位点，辅助基因功能挖掘。