公开(公告)号：CN114925837B

公开(公告)日：2024-04-16

申请号：CN202210294214.9

申请日：2022-03-23

Applicant: 华中农业大学

Inventor： 刘建晓 ,  雷继萌 ,  蔡纵横 ,  何欣怡 ,  郑婉婷

IPC: G06N7/01 ,  G06N5/04 ,  G06F17/16 ,  G06F17/18

Abstract: 本发明公开了一种基于混合熵优化互信息的基因调控网络构建方法，该方法包括：根据设置的离散度对基因表达连续型数据进行离散化处理，根据真实概率与James‑Stein估计概率产生的均方误差MSE计算得到收缩强度λ；根据概率与熵值的转换公式，得到James‑Stein估计熵值；通过概率分布的β矩求导简化Dirichlet先验分布下的贝叶斯熵值估计，将两种熵值估计器得到的值转换为互信息矩阵；计算与互信息矩阵类似的Z‑score矩阵，将两个矩阵组合得到初始基因调控网络；根据路径一致算法进行遍历，通过动态阈值对基因调控网络中基因间关系进一步进行筛选，得到最终的基因调控网络。本发明解决了现有技术中构建网络存在大量错误调控关系的问题，得到了更准确的基因调控网络。

公开(公告)号：CN114925837A

公开(公告)日：2022-08-19

申请号：CN202210294214.9

申请日：2022-03-23

Applicant: 华中农业大学

Inventor： 刘建晓 ,  雷继萌 ,  蔡纵横 ,  何欣怡 ,  郑婉婷

IPC: G06N7/00 ,  G06N5/04 ,  G06F17/16 ,  G06F17/18

Abstract: 本发明公开了一种基于混合熵优化互信息的基因调控网络构建方法，该方法包括：根据设置的离散度对基因表达连续型数据进行离散化处理，根据真实概率与James‑Stein估计概率产生的均方误差MSE计算得到收缩强度λ；根据概率与熵值的转换公式，得到James‑Stein估计熵值；通过概率分布的β矩求导简化Dirichlet先验分布下的贝叶斯熵值估计，将两种熵值估计器得到的值转换为互信息矩阵；计算与互信息矩阵类似的Z‑score矩阵，将两个矩阵组合得到初始基因调控网络；根据路径一致算法进行遍历，通过动态阈值对基因调控网络中基因间关系进一步进行筛选，得到最终的基因调控网络。本发明解决了现有技术中构建网络存在大量错误调控关系的问题，得到了更准确的基因调控网络。