一种基于EST数据挖掘的抗病基因同源物的标记方法

    公开(公告)号:CN102747154A

    公开(公告)日:2012-10-24

    申请号:CN201210230401.7

    申请日:2012-07-05

    Abstract: 本发明公开了一种基于EST数据挖掘的抗病基因同源物的标记方法,其步骤:(1)序列挖掘及引物设计;(2)RGA序列挖掘及引物设计:通过文献收集了96条不同物种的R蛋白序列,同时下载拟南芥中196条R蛋白序列,从TIGR中下载3个棉种的EST数据;(3)对开发的标记进行遗传定位:所用的海陆种间BC1群体,然后在单链构象多态性电泳条件下利用亲本鄂棉22和3-79筛选多态性,筛选出的多态性标记对BC1群体进行多态性分析,数据导入JoinMap3.0构建。本发明成本更低,无需简并引物扩增与大量单克隆测序非费用,而且得到的序列数目更多,序列类型也更加丰富。能够为分子育种提供有效的分子标记。

Patent Agency Ranking