公开(公告)号：CN113981078A

公开(公告)日：2022-01-28

申请号：CN202111089720.6

申请日：2021-09-16

Applicant: 北京肿瘤医院(北京大学肿瘤医院) ,  无锡臻和生物科技有限公司

Inventor： 鲁智豪 ,  张恒辉 ,  沈琳 ,  陈欢 ,  李健 ,  毛蓓蓓 ,  张小田 ,  洪媛媛 ,  彭智 ,  胡莹

IPC: C12Q1/6886 ,  C12Q1/6869

Abstract: 本发明提供了一种用于预测晚期食管癌患者抗EGFR靶向治疗疗效的生物标志物及疗效预测试剂盒，其中，生物标志物获取方法包括：提取待检测样本RNA，将待检测样本RNA打断，进行反转录，得到cDNA；基于cDNA通过末端修复、接头连接和文库富集方法构建基因文库；通过捕获探针与目标区域特异性杂交从构建的基因文库中捕获并富集目标基因；利用高通量测序仪测序，获得RNA靶向测序数据；采用RPKM方法定量评估RNA靶向测序数据中基因ALK、NTRK2及NTRK3的表达量；基于评估得到的表达量取平均数得到生物标志物。具备检测灵敏度高、测序费用低、节省探针等优点，更适用于临床试剂盒开发。

公开(公告)号：CN114974420A

公开(公告)日：2022-08-30

申请号：CN202111280551.4

申请日：2021-10-29

Applicant: 无锡臻和生物科技有限公司 ,  北京肿瘤医院(北京大学肿瘤医院)

Inventor： 张恒辉 ,  沈琳 ,  陈欢 ,  鲁智豪 ,  胡莹 ,  李健 ,  孙怀博 ,  张小田 ,  毛蓓蓓 ,  彭智

IPC: G16B30/00 ,  G16B50/00 ,  G16H50/30

Abstract: 本发明提出了一种预测胃肠肿瘤免疫检查点抑制剂治疗疗效的标志物及其应用，该标志物为HLA‑B趋异进化指数(HLA‑BHED)，HLA‑B趋异进化指数(HLA‑BHED)具有可以作为预测对象胃肠肿瘤免疫检查点抑制剂疗效的标志物的用途。根据本发明所述的HLA‑B基因的趋异进化指数(HLA‑BHED)通过反映机体HLA分子与抗原肽结合域的序列多样性准确预测所述免疫检查点抑制剂对胃肠肿瘤的治疗效果，HLA‑BHED指数高的对象，HLA‑B能够结合多种抗原肽提呈给T细胞诱导免疫应答，所述对象给予免疫检查点抑制剂治疗后展现出临床显著获益，总生存期及无病进展期显著延长。

公开(公告)号：CN113981078B

公开(公告)日：2023-11-24

申请号：CN202111089720.6

申请日：2021-09-16

Applicant: 北京肿瘤医院(北京大学肿瘤医院) ,  无锡臻和生物科技有限公司

Inventor： 鲁智豪 ,  张恒辉 ,  沈琳 ,  陈欢 ,  李健 ,  毛蓓蓓 ,  张小田 ,  洪媛媛 ,  彭智 ,  胡莹

IPC: C12Q1/6886 ,  C12Q1/6869

Abstract: 本发明提供了一种用于预测晚期食管癌患者抗EGFR靶向治疗疗效的生物标志物及疗效预测试剂盒，其中，生物标志物获取方法包括：提取待检测样本RNA，将待检测样本RNA打断，进行反转录，得到cDNA；基于cDNA通过末端修复、接头连接和文库富集方法构建基因文库；通过捕获探针与目标区域特异性杂交从构建的基因文库中捕获并富集目标基因；利用高通量测序仪测序，获得RNA靶向测序数据；采用RPKM方法定量评估RNA靶向测序数据中基因ALK、NTRK2及NTRK3的表达量；基于评估得到的表达量取平均数得到生物标志物。具备检测灵敏度高、测序费用低、节省探针等优点，更适用于临床试剂盒开发。

公开(公告)号：CN114231628A

公开(公告)日：2022-03-25

申请号：CN202111466674.7

申请日：2021-12-03

Applicant: 无锡臻和生物科技有限公司 ,  北京肿瘤医院(北京大学肿瘤医院)

Inventor： 张恒辉 ,  沈琳 ,  张磊 ,  鲁智豪 ,  杨滢 ,  李健 ,  孙怀博 ,  张小田 ,  杜波 ,  彭智

IPC: C12Q1/6886 ,  C12N15/11 ,  G16B20/20

Abstract: 本发明提出了一种预测胃肠肿瘤免疫检查点抑制剂治疗疗效的标志物组合及其应用，该标志物组合所述标志物组合包含HLA‑B62超型中的至少之一。根据本发明实施例的标志物组合可以对对象胃肠肿瘤免疫检查点抑制剂的治疗疗效进行准确预测，如PD‑1/PD‑L1抑制剂单用，或与CTLA‑4抑制剂联用，提高胃肠肿瘤免疫检查点抑制剂治疗的响应率。

公开(公告)号：CN118853885A

公开(公告)日：2024-10-29

申请号：CN202411004278.6

申请日：2024-07-25

Applicant: 北京肿瘤医院(北京大学肿瘤医院)

Inventor： 焦曦 ,  马家铖 ,  鲁智豪 ,  沈琳 ,  张新帅

IPC: C12Q1/6886 ,  G16B20/50 ,  G06F17/18 ,  G16B40/00 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明实施例提供一种用于预测单基因突变或通路基因突变对免疫治疗预后及免疫微环境相关性的应用和方法，其中所述单基因包括ARID1A、KMT2D、COL11A1中的至少一个或多个基因，所述通路基因突变包括补体激活调节通路突变。通过本发明可以评估某一基因或通路突变对免疫治疗的预后价值及疗效预测价值，并且能够更加全面地分析基因突变谱与免疫微环境特征的关系。