公开(公告)号：CN114372062A

公开(公告)日：2022-04-19

申请号：CN202210052851.5

申请日：2022-01-18

Applicant: 北京工业大学

Inventor： 刘博 ,  王志晗 ,  张冀东 ,  武嘉慧

IPC: G06F16/22 ,  G06F16/583 ,  G06K9/62 ,  G06V10/74 ,  G06V10/774 ,  G06V10/82 ,  G06N3/04 ,  G06N3/08

Abstract: 本发明公开了一种基于特征交互神经张量网络的图结构数据相似度计算方法，即DeepSIM模型，属于深度学习领域，首先使用共享权值的图卷积层构建孪生图卷积模块用以获得两个图结构数据的一对节点级嵌入。然后将这一对节点级嵌入输入图注意力层以聚合节点级信息得到图级嵌入。针对图级嵌入，本发明提出的FINTN能够有效推理二者之间的关联并输出固定维度的关系向量。这一关系向量输入到由全连接层构成的结果输出模块得到预测输出。这一预测输出与实际的标签值进行比较，通过损失函数和反向传播算法对整体模型参数进行更新以达学习的目的。完成训练的DeepSIM模型能高效可靠地计算输入的两个图结构数据的相似度。

公开(公告)号：CN114464249A

公开(公告)日：2022-05-10

申请号：CN202111669140.4

申请日：2021-12-31

Applicant: 北京工业大学

Inventor： 刘博 ,  张冀东 ,  王志晗 ,  武嘉慧

IPC: G16B20/00 ,  G16B30/00 ,  G06N3/04 ,  G06N3/08

Abstract: 本发明公开了一种基于自注意力卷积的核糖核酸‑蛋白质位点识别方法，从相关公开数据集库或相关公开数据网站获取RBP结合位点序列数据；预处理数据集，利用独热编码对数据进行重新编码，作为模型的输入数据将处理好的训练集数据输入到模型当中，利用损失函数和反向传播算法自更新模型参数。通过设置的好的早停法，获取最优模型并保存该模型。整体完成后利用测试集进行测试。本发明通过多头自注意力机制捕获全局特征，有效的弥补卷积方法只能关注局部特征的问题，在有效降低模型参数量的同时仍可保持模型整体分析效果。

公开(公告)号：CN114511708B

公开(公告)日：2024-06-11

申请号：CN202210059012.6

申请日：2022-01-18

Applicant: 北京工业大学

Inventor： 刘博 ,  武嘉慧 ,  王志晗 ,  张冀东

IPC: G06V10/44 ,  G06V10/764 ,  G06V10/82 ,  G06V10/74 ,  G06N3/042 ,  G06N3/0464 ,  G06N3/084

Abstract: 本发明公开了基于节点级嵌入特征三维关系重建的图数据相似度方法，属于深度学习领域，首先通过孪生图卷积层和相似节点交互模块生成节点级嵌入特征三维关系，然后将节点级嵌入特征三维关系经过三维卷积提取特征，将三维特征经过Flatten层展开为一维，获得最终节点级关系向量。这一关系向量输入到由全连接层构成的结果输出模块得到预测输出。这一预测输出与实际的标签值进行比较，通过损失函数和反向传播算法对整体模型参数进行更新以达到学习的目的。完成训练的DeepSIM‑3D模型能高效可靠地计算输入的两个图结构数据的相似度。

公开(公告)号：CN114511708A

公开(公告)日：2022-05-17

申请号：CN202210059012.6

申请日：2022-01-18

Applicant: 北京工业大学

Inventor： 刘博 ,  武嘉慧 ,  王志晗 ,  张冀东

IPC: G06V10/44 ,  G06V10/764 ,  G06V10/82 ,  G06V10/74 ,  G06K9/62 ,  G06N3/04 ,  G06N3/08

Abstract: 本发明公开了基于节点级嵌入特征三维关系重建的图数据相似度方法，属于深度学习领域，首先通过孪生图卷积层和相似节点交互模块生成节点级嵌入特征三维关系，然后将节点级嵌入特征三维关系经过三维卷积提取特征，将三维特征经过Flatten层展开为一维，获得最终节点级关系向量。这一关系向量输入到由全连接层构成的结果输出模块得到预测输出。这一预测输出与实际的标签值进行比较，通过损失函数和反向传播算法对整体模型参数进行更新以达到学习的目的。完成训练的DeepSIM‑3D模型能高效可靠地计算输入的两个图结构数据的相似度。