一种基于氨基酸序列的蛋白质折叠类型识别方法

    公开(公告)号:CN107423577A

    公开(公告)日:2017-12-01

    申请号:CN201710259671.3

    申请日:2017-04-20

    Inventor: 李晓琴 景娅楠

    Abstract: 本发明公开一种基于氨基酸序列的蛋白质折叠类型识别方法,步骤1、为α,β,α/β,α+β四类蛋白分别以家族和超家族为单位建立隐马尔科夫模型,分别以家族和超家族为代表的折叠类型识别模型集,同时对两个模型集分别进行扩充形成扩充家族模型集和扩充超家族模型集;步骤2、根据所述折叠类型识别模型集,进行蛋白质折叠类型自动化识别。采用本发明,能够扩大识别的样本覆盖范围并提高折叠类型识别的准确率,同时实现了折叠类型识别的自动化操作减少因人为因素造成的识别效果不佳的现象。

    皮肤软组织生物力学参数测量的装置及方法

    公开(公告)号:CN108760489B

    公开(公告)日:2021-04-02

    申请号:CN201810433049.4

    申请日:2018-05-08

    Abstract: 本发明公开了一种皮肤软组织生物力学参数测量的装置及方法。其特征是:设计了一套针对皮肤软组织的生物力学参数测量装置,并建立了基于该测量装置的皮肤软组织生物力学参数测量方法。测量装置可实现皮肤软组织的规范切割,确保在测试过程中皮肤样本不发生滑移及机器损伤;测量方法可实现人体皮肤软组织的生物力学参数测试的规范化,保证皮肤软组织生物力学参数测量的有效性及准确性。

    基于皮肤软组织形变的修复体再修复方法

    公开(公告)号:CN108888385A

    公开(公告)日:2018-11-27

    申请号:CN201810441493.0

    申请日:2018-05-10

    Abstract: 基于皮肤软组织形变的修复体再修复方法属于整形外科研究领域。本发明对类平面体修复体和非平面体修复体,分别建立修复体再修复方法;类平面修复体:具体包括额头修复体和颞部修复体,非平面修复体:包括鼻修复体;类平面修复体的植入,使植入部位的皮肤软组织厚度均匀减少,利用皮肤软组织体积恒定的条件,计算植入前后皮肤软组织厚度变化量,并利用皮肤软组织厚度变化量对进行修复;非平面修复体类似于平面修复体进行回折的结果,其修复体修复方法将在类平面修复体修复方法的基础上,计算由于植入修复体回折使皮肤软组织应力发生变化,并利用该应力变化对修复体进行二次修复。本发明解决由于皮肤软组织变形对整形修复效果的影响。

    一种蛋白质折叠类型分类方法

    公开(公告)号:CN106951738A

    公开(公告)日:2017-07-14

    申请号:CN201710259678.5

    申请日:2017-04-20

    Inventor: 李晓琴 张业晓

    Abstract: 本发明公开一种蛋白质折叠类型分类方法包括以下步骤:步骤1、构建模板数据库;步骤2、基于模板数据库,将任意待测蛋白样本与模板数据中的所有模板进行TM‑align比对,计算TM‑score值,所述TM‑score取值最大的模板所在的折叠类型即为待测蛋白样本所属折叠类型。采用本发明的技术方案,实现蛋白质折叠类型的自动化分类。

    一种基于氨基酸序列的蛋白质折叠类型识别方法

    公开(公告)号:CN107423577B

    公开(公告)日:2020-09-25

    申请号:CN201710259671.3

    申请日:2017-04-20

    Inventor: 李晓琴 景娅楠

    Abstract: 本发明公开一种基于氨基酸序列的蛋白质折叠类型识别方法,步骤1、为α,β,α/β,α+β四类蛋白分别以家族和超家族为单位建立隐马尔科夫模型,分别以家族和超家族为代表的折叠类型识别模型集,同时对两个模型集分别进行扩充形成扩充家族模型集和扩充超家族模型集;步骤2、根据所述折叠类型识别模型集,进行蛋白质折叠类型自动化识别。采用本发明,能够扩大识别的样本覆盖范围并提高折叠类型识别的准确率,同时实现了折叠类型识别的自动化操作减少因人为因素造成的识别效果不佳的现象。

    基于皮肤软组织形变的修复体再修复方法

    公开(公告)号:CN108888385B

    公开(公告)日:2020-08-07

    申请号:CN201810441493.0

    申请日:2018-05-10

    Abstract: 基于皮肤软组织形变的修复体再修复方法属于整形外科研究领域。本发明对类平面体修复体和非平面体修复体,分别建立修复体再修复方法;类平面修复体:具体包括额头修复体和颞部修复体,非平面修复体:包括鼻修复体;类平面修复体的植入,使植入部位的皮肤软组织厚度均匀减少,利用皮肤软组织体积恒定的条件,计算植入前后皮肤软组织厚度变化量,并利用皮肤软组织厚度变化量对进行修复;非平面修复体类似于平面修复体进行回折的结果,其修复体修复方法将在类平面修复体修复方法的基础上,计算由于植入修复体回折使皮肤软组织应力发生变化,并利用该应力变化对修复体进行二次修复。本发明解决由于皮肤软组织变形对整形修复效果的影响。

    一种乳腺癌发生相关特征基因筛选方法

    公开(公告)号:CN107729718A

    公开(公告)日:2018-02-23

    申请号:CN201710966853.4

    申请日:2017-10-17

    CPC classification number: G16B40/00 G06K9/6269 G16B20/00

    Abstract: 本发明公开了一种乳腺癌发生相关特征基因筛选方法,以TCGA数据库中乳腺癌数据为研究对象,采用多重特征基因筛选方法,分别从相关性、特异性和生物学功能等多个方面,筛选真正的特征基因。使用本发明可基于癌症基因组学数据,利用该特征基因提取方法,提取出与癌症早期发生相关的基因,并建立分类模型,从而实现乳腺癌早期自动化诊断。

    一种HIV-1整合酶突变株对EVG耐药倍数变化值的预测方法

    公开(公告)号:CN105279395A

    公开(公告)日:2016-01-27

    申请号:CN201510685897.0

    申请日:2015-10-20

    Abstract: 一种HIV-1整合酶突变株对EVG耐药倍数变化值的预测方法,属于生物信息学领域。该方法包括以下几个步骤:(1)编码数据集。建立一个主要突变的基因型及其对应的表现型log FC值得数据集;(2)根据突变导致残基侧链理化性质变化是否一致将数据集中的基因型进行了三种不同的整合,三种整合依据分别为体积变化、电荷变化,综合体积电荷变化;(3)聚类分析法除去异常值;(4)将步骤(3)得到的三类数据集用遗传算法筛选得到优秀种群个体;(5)将三类数据集分别建立多元逐步回归模型。得到回归方程,复相关系数等参数;(6)将待预测的数据带入到回归方程,便可得到相对应的预测值。

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