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公开(公告)号:CN113718053A
公开(公告)日:2021-11-30
申请号:CN202111160897.0
申请日:2021-09-30
Applicant: 北京大学第一医院
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/686 , C12Q1/04 , C12N15/11
Abstract: 本发明属于真菌检测技术领域,具体涉及一种用于检测耶氏肺孢子菌探针及引物对及检测方法和应用。所述探针及引物对选择以下任意两组中其中一组:(1)探针及引物对a,其中,探针包含如sequence NO.1所示的核酸序列,引物对包含如sequence NO.3和sequence NO.4所示的核酸序列;或(2)探针及引物对b,其中,探针包含如sequence NO.2所示的核酸序列,引物对包含如sequence NO.5和sequence NO.6所示的核酸序列。使用该探针及引物进行qPCR检测样本时,在菌株间无交叉反应,特异性高;且具有较高的灵敏度。
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公开(公告)号:CN112980997A
公开(公告)日:2021-06-18
申请号:CN202110452396.3
申请日:2021-04-26
Applicant: 北京大学第一医院
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6851 , C12Q1/06 , C12N15/11 , C12R1/785 , C12R1/845 , C12R1/645
Abstract: 本发明公开了一种侵袭性毛霉病病原菌的引物和探针及其实现方法、检测系统,所述方法包括:对已获取的侵袭性毛霉病病原菌各菌种的全基因组数据进行比对,得到侵袭性毛霉病病原菌的多个保守基因;利用通过全基因组数据比对得到的侵袭性毛霉病病原菌的多个保守基因,设计特异性满足要求的侵袭性毛霉病病原菌的通用引物和探针以及侵袭性毛霉病病原菌各菌种的种特异性引物和探针。利用本发明所设计的引物和探针,可以提高侵袭性曲霉病病原菌检测的灵敏度和特异度、可检测包括烟曲霉、黄曲霉、土曲霉、黑曲霉、构巢曲霉在内的多种菌种,适用于BALF及FFPE组织、渗出液(脓液)等不同临床样本。
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公开(公告)号:CN113106167A
公开(公告)日:2021-07-13
申请号:CN202110452771.4
申请日:2021-04-26
Applicant: 北京大学第一医院
Abstract: 本发明公开了一种侵袭性曲霉病病原菌的引物和探针及其实现方法、检测系统,所述方法包括:对已获取的侵袭性曲霉病病原菌各菌种的全基因组数据进行比对,得到侵袭性曲霉病病原菌的多个保守基因;利用通过全基因组数据比对得到的侵袭性曲霉病病原菌的多个保守基因,设计特异性满足要求的侵袭性曲霉病病原菌的通用引物和探针以及侵袭性曲霉病病原菌各菌种的种特异性引物和探针。利用本发明设计的引物和探针,可以提高侵袭性曲霉病病原菌检测的灵敏度和特异度、检测菌种多,且适用于BALF及FFPE组织、渗出液(脓液)等不同临床样本。
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公开(公告)号:CN112980981B
公开(公告)日:2022-08-30
申请号:CN202110452654.8
申请日:2021-04-26
Applicant: 北京大学第一医院
Abstract: 本发明公开了一种皮肤感染性肉芽肿病原菌的引物和探针、实现方法、检测系统,所述方法包括:对已获取的皮肤感染性肉芽肿病原菌中分枝杆菌各菌种的全基因组数据进行比对,得到分枝杆菌的多个保守基因;利用通过全基因组数据比对得到的分枝杆菌的多个保守基因,设计特异性满足要求的分枝杆菌的通用引物和探针以及分枝杆菌各菌种的种特异性引物和探针。利用本发明的引物和探针,可以提高皮肤感染性肉芽肿病原菌检测的灵敏度和特异度低、且检测菌种多、特别是皮肤组织样本中的病原菌检出率高。
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公开(公告)号:CN112980981A
公开(公告)日:2021-06-18
申请号:CN202110452654.8
申请日:2021-04-26
Applicant: 北京大学第一医院
Abstract: 本发明公开了一种皮肤感染性肉芽肿病原菌的引物和探针、实现方法、检测系统,所述方法包括:对已获取的皮肤感染性肉芽肿病原菌中分枝杆菌各菌种的全基因组数据进行比对,得到分枝杆菌的多个保守基因;利用通过全基因组数据比对得到的分枝杆菌的多个保守基因,设计特异性满足要求的分枝杆菌的通用引物和探针以及分枝杆菌各菌种的种特异性引物和探针。利用本发明的引物和探针,可以提高皮肤感染性肉芽肿病原菌检测的灵敏度和特异度低、且检测菌种多、特别是皮肤组织样本中的病原菌检出率高。
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公开(公告)号:CN113881789B
公开(公告)日:2024-01-19
申请号:CN202111160891.3
申请日:2021-09-30
Applicant: 北京大学第一医院
IPC: C12Q1/689 , C12Q1/6851 , C12Q1/04 , C12N15/11
Abstract: 本发明属于真菌检测技术领域,具体涉及一种用于检测隐球菌的探针及引物对组合物及检测方法和应用。该组合物包含:包含探针a和引物对a的第一组分和/或包含探针b和引物对b的第二组分和/或包含探针c和引物对c的第三组分和/或包含探针d和引物对d的第四组分。该组合物在检测菌株水平灵敏度较好,可检测DNA浓度为fg水平的样本,且菌株间无交叉反应,而且包含属水平及变种水平,可双重验证检测的准确性。使用该引物和探针的检测方法可用于不同临床样本(BALF及FFPE组织、渗出液(脓液))的检测,灵敏度较高。
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公开(公告)号:CN113106167B
公开(公告)日:2022-09-20
申请号:CN202110452771.4
申请日:2021-04-26
Applicant: 北京大学第一医院
Abstract: 本发明公开了一种侵袭性曲霉病病原菌的引物和探针及其实现方法、检测系统,所述方法包括:对已获取的侵袭性曲霉病病原菌各菌种的全基因组数据进行比对,得到侵袭性曲霉病病原菌的多个保守基因;利用通过全基因组数据比对得到的侵袭性曲霉病病原菌的多个保守基因,设计特异性满足要求的侵袭性曲霉病病原菌的通用引物和探针以及侵袭性曲霉病病原菌各菌种的种特异性引物和探针。利用本发明设计的引物和探针,可以提高侵袭性曲霉病病原菌检测的灵敏度和特异度、检测菌种多,且适用于BALF及FFPE组织、渗出液(脓液)等不同临床样本。
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公开(公告)号:CN112980997B
公开(公告)日:2022-09-13
申请号:CN202110452396.3
申请日:2021-04-26
Applicant: 北京大学第一医院
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6851 , C12Q1/06 , C12N15/11 , C12R1/785 , C12R1/845 , C12R1/645
Abstract: 本发明公开了一种侵袭性毛霉病病原菌的引物和探针及其实现方法、检测系统,所述方法包括:对已获取的侵袭性毛霉病病原菌各菌种的全基因组数据进行比对,得到侵袭性毛霉病病原菌的多个保守基因;利用通过全基因组数据比对得到的侵袭性毛霉病病原菌的多个保守基因,设计特异性满足要求的侵袭性毛霉病病原菌的通用引物和探针以及侵袭性毛霉病病原菌各菌种的种特异性引物和探针。利用本发明所设计的引物和探针,可以提高侵袭性曲霉病病原菌检测的灵敏度和特异度、可检测包括烟曲霉、黄曲霉、土曲霉、黑曲霉、构巢曲霉在内的多种菌种,适用于BALF及FFPE组织、渗出液(脓液)等不同临床样本。
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公开(公告)号:CN113881789A
公开(公告)日:2022-01-04
申请号:CN202111160891.3
申请日:2021-09-30
Applicant: 北京大学第一医院
IPC: C12Q1/689 , C12Q1/6851 , C12Q1/04 , C12N15/11
Abstract: 本发明属于真菌检测技术领域,具体涉及一种用于检测隐球菌的探针及引物对组合物及检测方法和应用。该组合物包含:包含探针a和引物对a的第一组分和/或包含探针b和引物对b的第二组分和/或包含探针c和引物对c的第三组分和/或包含探针d和引物对d的第四组分。该组合物在检测菌株水平灵敏度较好,可检测DNA浓度为fg水平的样本,且菌株间无交叉反应,而且包含属水平及变种水平,可双重验证检测的准确性。使用该引物和探针的检测方法可用于不同临床样本(BALF及FFPE组织、渗出液(脓液))的检测,灵敏度较高。
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