公开(公告)号：CN119710077A

公开(公告)日：2025-03-28

申请号：CN202510233656.6

申请日：2025-02-28

Applicant: 北京大学现代农业研究院 ,  潍坊现代农业山东省实验室

Inventor： 杨长宪 ,  郭立 ,  牟雨沛 ,  石春美 ,  陈绍英 ,  孙聪颖 ,  王靖萱

IPC: C12Q1/6895 ,  C12N15/82 ,  C12N15/11 ,  C12N15/29 ,  A01H5/00 ,  A01H6/82

Abstract: 本发明提供了一种与番茄灰霉病抗性相关的分子标记及其应用。其中，分子标记为番茄9号染色体上的一个937bp的染色体结构变异SV片段，所述染色体结构变异SV片段具有如SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列，或与所述核苷酸序列具有90%以上同源性的核苷酸序列。利用本申请在番茄9号染色体上的一个937bp的染色体结构变异SV作为检测番茄灰霉病抗性的分子标记，能够快速区分番茄材料的抗病性，为番茄育种提供了有力的工具。

公开(公告)号：CN117953964A

公开(公告)日：2024-04-30

申请号：CN202410342341.0

申请日：2024-03-25

Applicant: 北京大学现代农业研究院

Inventor： 杨博文 ,  郭立

IPC: G16B15/30 ,  G16B30/00 ,  G16B50/10

Abstract: 本发明属于生物信息学技术领域，公开了一种基于因果性、倍数变化及大语言AI的基因‑代谢物对筛选方法，包括：对来自不同时间点的样本进行转录组测序，进行生物信息注释和定量，获得基因表达矩阵；对来自不同时间点的样本进行基于质谱的代谢组检测，进行生物信息注释与定量，获得代谢物浓度矩阵；选择目标代谢物，计算每个基因与代谢物间的关联强度，进行启发式排序；利用人工智能大语言模型进行基于基因功能注释和先验知识的启发式回答。本发明运用收敛交叉映射和格兰杰因果检验，结合大语言模型，准确判定基因与代谢物的因果关系，适用于处理复杂时间序列数据，提高结论的生物学可靠性，助力科研人员快速识别关键基因，为后续实验验证提供有力支持。